Protein–RNA interactions for Protein: P0DP42

TMEM225B, Transmembrane protein 225B, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM225BP0DP42 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM225BP0DP42 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM225BP0DP42 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM225BP0DP42 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM225BP0DP42 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM225BP0DP42 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM225BP0DP42 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM225BP0DP42 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM225BP0DP42 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM225BP0DP42 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM225BP0DP42 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM225BP0DP42 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM225BP0DP42 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM225BP0DP42 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM225BP0DP42 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM225BP0DP42 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM225BP0DP42 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM225BP0DP42 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM225BP0DP42 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM225BP0DP42 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM225BP0DP42 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM225BP0DP42 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM225BP0DP42 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM225BP0DP42 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM225BP0DP42 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM225BP0DP42 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM225BP0DP42 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM225BP0DP42 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM225BP0DP42 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM225BP0DP42 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM225BP0DP42 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM225BP0DP42 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM225BP0DP42 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM225BP0DP42 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM225BP0DP42 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM225BP0DP42 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM225BP0DP42 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM225BP0DP42 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM225BP0DP42 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM225BP0DP42 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM225BP0DP42 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM225BP0DP42 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM225BP0DP42 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM225BP0DP42 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM225BP0DP42 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM225BP0DP42 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM225BP0DP42 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM225BP0DP42 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM225BP0DP42 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM225BP0DP42 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM225BP0DP42 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM225BP0DP42 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM225BP0DP42 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM225BP0DP42 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM225BP0DP42 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM225BP0DP42 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM225BP0DP42 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMEM225BP0DP42 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMEM225BP0DP42 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMEM225BP0DP42 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMEM225BP0DP42 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMEM225BP0DP42 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMEM225BP0DP42 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMEM225BP0DP42 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMEM225BP0DP42 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMEM225BP0DP42 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMEM225BP0DP42 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMEM225BP0DP42 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMEM225BP0DP42 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMEM225BP0DP42 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMEM225BP0DP42 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMEM225BP0DP42 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMEM225BP0DP42 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMEM225BP0DP42 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMEM225BP0DP42 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
TMEM225BP0DP42 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMEM225BP0DP42 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
TMEM225BP0DP42 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMEM225BP0DP42 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMEM225BP0DP42 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMEM225BP0DP42 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMEM225BP0DP42 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
TMEM225BP0DP42 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
TMEM225BP0DP42 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TMEM225BP0DP42 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TMEM225BP0DP42 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TMEM225BP0DP42 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TMEM225BP0DP42 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
TMEM225BP0DP42 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TMEM225BP0DP42 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TMEM225BP0DP42 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TMEM225BP0DP42 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TMEM225BP0DP42 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TMEM225BP0DP42 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
TMEM225BP0DP42 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TMEM225BP0DP42 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TMEM225BP0DP42 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
TMEM225BP0DP42 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TMEM225BP0DP42 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TMEM225BP0DP42 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms