Protein–RNA interactions for Protein: P0C2S0

CTXN2, Cortexin-2, humanhuman

Predictions only

Length 81 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTXN2P0C2S0 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTXN2P0C2S0 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTXN2P0C2S0 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTXN2P0C2S0 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTXN2P0C2S0 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTXN2P0C2S0 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTXN2P0C2S0 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTXN2P0C2S0 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTXN2P0C2S0 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTXN2P0C2S0 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CTXN2P0C2S0 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTXN2P0C2S0 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTXN2P0C2S0 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTXN2P0C2S0 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CTXN2P0C2S0 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTXN2P0C2S0 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CTXN2P0C2S0 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CTXN2P0C2S0 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTXN2P0C2S0 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTXN2P0C2S0 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTXN2P0C2S0 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CTXN2P0C2S0 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTXN2P0C2S0 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTXN2P0C2S0 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTXN2P0C2S0 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTXN2P0C2S0 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTXN2P0C2S0 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTXN2P0C2S0 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTXN2P0C2S0 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTXN2P0C2S0 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTXN2P0C2S0 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTXN2P0C2S0 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTXN2P0C2S0 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CTXN2P0C2S0 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CTXN2P0C2S0 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CTXN2P0C2S0 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CTXN2P0C2S0 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CTXN2P0C2S0 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CTXN2P0C2S0 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CTXN2P0C2S0 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CTXN2P0C2S0 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CTXN2P0C2S0 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CTXN2P0C2S0 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CTXN2P0C2S0 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CTXN2P0C2S0 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CTXN2P0C2S0 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CTXN2P0C2S0 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CTXN2P0C2S0 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CTXN2P0C2S0 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CTXN2P0C2S0 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CTXN2P0C2S0 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CTXN2P0C2S0 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CTXN2P0C2S0 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CTXN2P0C2S0 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CTXN2P0C2S0 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CTXN2P0C2S0 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CTXN2P0C2S0 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CTXN2P0C2S0 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CTXN2P0C2S0 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CTXN2P0C2S0 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CTXN2P0C2S0 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CTXN2P0C2S0 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CTXN2P0C2S0 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CTXN2P0C2S0 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CTXN2P0C2S0 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CTXN2P0C2S0 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTXN2P0C2S0 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTXN2P0C2S0 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTXN2P0C2S0 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTXN2P0C2S0 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTXN2P0C2S0 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTXN2P0C2S0 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTXN2P0C2S0 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTXN2P0C2S0 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CTXN2P0C2S0 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTXN2P0C2S0 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTXN2P0C2S0 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTXN2P0C2S0 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTXN2P0C2S0 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTXN2P0C2S0 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTXN2P0C2S0 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTXN2P0C2S0 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTXN2P0C2S0 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTXN2P0C2S0 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTXN2P0C2S0 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTXN2P0C2S0 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTXN2P0C2S0 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTXN2P0C2S0 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTXN2P0C2S0 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTXN2P0C2S0 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTXN2P0C2S0 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTXN2P0C2S0 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTXN2P0C2S0 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTXN2P0C2S0 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTXN2P0C2S0 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTXN2P0C2S0 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTXN2P0C2S0 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTXN2P0C2S0 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTXN2P0C2S0 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTXN2P0C2S0 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms