Protein–RNA interactions for Protein: P07333

CSF1R, Macrophage colony-stimulating factor 1 receptor, humanhuman

Predictions only

Length 972 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSF1RP07333 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CSF1RP07333 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CSF1RP07333 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CSF1RP07333 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CSF1RP07333 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CSF1RP07333 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CSF1RP07333 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CSF1RP07333 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CSF1RP07333 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CSF1RP07333 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CSF1RP07333 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CSF1RP07333 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CSF1RP07333 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CSF1RP07333 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CSF1RP07333 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CSF1RP07333 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CSF1RP07333 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CSF1RP07333 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CSF1RP07333 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CSF1RP07333 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CSF1RP07333 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CSF1RP07333 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CSF1RP07333 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CSF1RP07333 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CSF1RP07333 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CSF1RP07333 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CSF1RP07333 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CSF1RP07333 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CSF1RP07333 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CSF1RP07333 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CSF1RP07333 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CSF1RP07333 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CSF1RP07333 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CSF1RP07333 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CSF1RP07333 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CSF1RP07333 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CSF1RP07333 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CSF1RP07333 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CSF1RP07333 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CSF1RP07333 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CSF1RP07333 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CSF1RP07333 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CSF1RP07333 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CSF1RP07333 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CSF1RP07333 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CSF1RP07333 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CSF1RP07333 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CSF1RP07333 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CSF1RP07333 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CSF1RP07333 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CSF1RP07333 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CSF1RP07333 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CSF1RP07333 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CSF1RP07333 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CSF1RP07333 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CSF1RP07333 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CSF1RP07333 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CSF1RP07333 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CSF1RP07333 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CSF1RP07333 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CSF1RP07333 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CSF1RP07333 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CSF1RP07333 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CSF1RP07333 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CSF1RP07333 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CSF1RP07333 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CSF1RP07333 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CSF1RP07333 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CSF1RP07333 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CSF1RP07333 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CSF1RP07333 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CSF1RP07333 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CSF1RP07333 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CSF1RP07333 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CSF1RP07333 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CSF1RP07333 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CSF1RP07333 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CSF1RP07333 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CSF1RP07333 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CSF1RP07333 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CSF1RP07333 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CSF1RP07333 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CSF1RP07333 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CSF1RP07333 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CSF1RP07333 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CSF1RP07333 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CSF1RP07333 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CSF1RP07333 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CSF1RP07333 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CSF1RP07333 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CSF1RP07333 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CSF1RP07333 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CSF1RP07333 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CSF1RP07333 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CSF1RP07333 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CSF1RP07333 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CSF1RP07333 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CSF1RP07333 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CSF1RP07333 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CSF1RP07333 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms