Protein–RNA interactions for Protein: P06340

HLA-DOA, HLA class II histocompatibility antigen, DO alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DOAP06340 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HLA-DOAP06340 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HLA-DOAP06340 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HLA-DOAP06340 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HLA-DOAP06340 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HLA-DOAP06340 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HLA-DOAP06340 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HLA-DOAP06340 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HLA-DOAP06340 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HLA-DOAP06340 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HLA-DOAP06340 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HLA-DOAP06340 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HLA-DOAP06340 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HLA-DOAP06340 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HLA-DOAP06340 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
HLA-DOAP06340 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HLA-DOAP06340 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HLA-DOAP06340 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HLA-DOAP06340 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HLA-DOAP06340 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HLA-DOAP06340 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HLA-DOAP06340 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HLA-DOAP06340 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HLA-DOAP06340 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
HLA-DOAP06340 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HLA-DOAP06340 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HLA-DOAP06340 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HLA-DOAP06340 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HLA-DOAP06340 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HLA-DOAP06340 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HLA-DOAP06340 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HLA-DOAP06340 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HLA-DOAP06340 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HLA-DOAP06340 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HLA-DOAP06340 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HLA-DOAP06340 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HLA-DOAP06340 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HLA-DOAP06340 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HLA-DOAP06340 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HLA-DOAP06340 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HLA-DOAP06340 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HLA-DOAP06340 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HLA-DOAP06340 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HLA-DOAP06340 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HLA-DOAP06340 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HLA-DOAP06340 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HLA-DOAP06340 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HLA-DOAP06340 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HLA-DOAP06340 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HLA-DOAP06340 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HLA-DOAP06340 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HLA-DOAP06340 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HLA-DOAP06340 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HLA-DOAP06340 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HLA-DOAP06340 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HLA-DOAP06340 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HLA-DOAP06340 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HLA-DOAP06340 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
HLA-DOAP06340 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HLA-DOAP06340 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HLA-DOAP06340 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HLA-DOAP06340 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HLA-DOAP06340 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HLA-DOAP06340 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HLA-DOAP06340 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HLA-DOAP06340 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HLA-DOAP06340 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HLA-DOAP06340 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HLA-DOAP06340 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
HLA-DOAP06340 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HLA-DOAP06340 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HLA-DOAP06340 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HLA-DOAP06340 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HLA-DOAP06340 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HLA-DOAP06340 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
HLA-DOAP06340 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
HLA-DOAP06340 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
HLA-DOAP06340 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
HLA-DOAP06340 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HLA-DOAP06340 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HLA-DOAP06340 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HLA-DOAP06340 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
HLA-DOAP06340 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HLA-DOAP06340 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HLA-DOAP06340 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HLA-DOAP06340 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HLA-DOAP06340 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HLA-DOAP06340 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HLA-DOAP06340 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HLA-DOAP06340 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HLA-DOAP06340 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HLA-DOAP06340 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HLA-DOAP06340 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HLA-DOAP06340 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HLA-DOAP06340 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HLA-DOAP06340 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HLA-DOAP06340 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HLA-DOAP06340 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HLA-DOAP06340 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HLA-DOAP06340 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.3 ms