Protein–RNA interactions for Protein: P01920

HLA-DQB1, HLA class II histocompatibility antigen, DQ beta 1 chain, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DQB1P01920 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HLA-DQB1P01920 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HLA-DQB1P01920 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HLA-DQB1P01920 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HLA-DQB1P01920 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
HLA-DQB1P01920 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HLA-DQB1P01920 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HLA-DQB1P01920 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HLA-DQB1P01920 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HLA-DQB1P01920 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HLA-DQB1P01920 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HLA-DQB1P01920 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
HLA-DQB1P01920 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HLA-DQB1P01920 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
HLA-DQB1P01920 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HLA-DQB1P01920 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HLA-DQB1P01920 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HLA-DQB1P01920 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HLA-DQB1P01920 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HLA-DQB1P01920 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HLA-DQB1P01920 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HLA-DQB1P01920 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HLA-DQB1P01920 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HLA-DQB1P01920 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HLA-DQB1P01920 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HLA-DQB1P01920 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HLA-DQB1P01920 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HLA-DQB1P01920 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HLA-DQB1P01920 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HLA-DQB1P01920 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HLA-DQB1P01920 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HLA-DQB1P01920 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HLA-DQB1P01920 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HLA-DQB1P01920 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HLA-DQB1P01920 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HLA-DQB1P01920 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HLA-DQB1P01920 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HLA-DQB1P01920 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HLA-DQB1P01920 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HLA-DQB1P01920 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HLA-DQB1P01920 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HLA-DQB1P01920 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HLA-DQB1P01920 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HLA-DQB1P01920 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HLA-DQB1P01920 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HLA-DQB1P01920 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HLA-DQB1P01920 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HLA-DQB1P01920 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HLA-DQB1P01920 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HLA-DQB1P01920 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HLA-DQB1P01920 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HLA-DQB1P01920 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HLA-DQB1P01920 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HLA-DQB1P01920 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HLA-DQB1P01920 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HLA-DQB1P01920 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HLA-DQB1P01920 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HLA-DQB1P01920 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HLA-DQB1P01920 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HLA-DQB1P01920 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HLA-DQB1P01920 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HLA-DQB1P01920 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HLA-DQB1P01920 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HLA-DQB1P01920 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HLA-DQB1P01920 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HLA-DQB1P01920 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HLA-DQB1P01920 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HLA-DQB1P01920 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HLA-DQB1P01920 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HLA-DQB1P01920 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HLA-DQB1P01920 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HLA-DQB1P01920 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HLA-DQB1P01920 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
HLA-DQB1P01920 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HLA-DQB1P01920 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HLA-DQB1P01920 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HLA-DQB1P01920 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HLA-DQB1P01920 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HLA-DQB1P01920 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HLA-DQB1P01920 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HLA-DQB1P01920 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HLA-DQB1P01920 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HLA-DQB1P01920 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HLA-DQB1P01920 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HLA-DQB1P01920 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HLA-DQB1P01920 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HLA-DQB1P01920 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HLA-DQB1P01920 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HLA-DQB1P01920 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HLA-DQB1P01920 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
HLA-DQB1P01920 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
HLA-DQB1P01920 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
HLA-DQB1P01920 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HLA-DQB1P01920 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HLA-DQB1P01920 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HLA-DQB1P01920 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HLA-DQB1P01920 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HLA-DQB1P01920 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
HLA-DQB1P01920 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HLA-DQB1P01920 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
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