Protein–RNA interactions for Protein: O95562

SFT2D2, Vesicle transport protein SFT2B, humanhuman

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFT2D2O95562 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SFT2D2O95562 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SFT2D2O95562 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SFT2D2O95562 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SFT2D2O95562 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SFT2D2O95562 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SFT2D2O95562 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SFT2D2O95562 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SFT2D2O95562 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SFT2D2O95562 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SFT2D2O95562 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SFT2D2O95562 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SFT2D2O95562 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SFT2D2O95562 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SFT2D2O95562 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SFT2D2O95562 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SFT2D2O95562 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SFT2D2O95562 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SFT2D2O95562 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SFT2D2O95562 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SFT2D2O95562 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SFT2D2O95562 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SFT2D2O95562 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SFT2D2O95562 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SFT2D2O95562 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SFT2D2O95562 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SFT2D2O95562 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SFT2D2O95562 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SFT2D2O95562 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SFT2D2O95562 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SFT2D2O95562 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SFT2D2O95562 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SFT2D2O95562 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SFT2D2O95562 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SFT2D2O95562 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SFT2D2O95562 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SFT2D2O95562 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SFT2D2O95562 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SFT2D2O95562 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SFT2D2O95562 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SFT2D2O95562 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SFT2D2O95562 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SFT2D2O95562 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SFT2D2O95562 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SFT2D2O95562 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SFT2D2O95562 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SFT2D2O95562 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SFT2D2O95562 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SFT2D2O95562 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SFT2D2O95562 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SFT2D2O95562 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SFT2D2O95562 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SFT2D2O95562 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SFT2D2O95562 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SFT2D2O95562 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SFT2D2O95562 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SFT2D2O95562 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SFT2D2O95562 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SFT2D2O95562 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SFT2D2O95562 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SFT2D2O95562 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SFT2D2O95562 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SFT2D2O95562 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SFT2D2O95562 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SFT2D2O95562 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
SFT2D2O95562 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SFT2D2O95562 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SFT2D2O95562 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SFT2D2O95562 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SFT2D2O95562 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SFT2D2O95562 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SFT2D2O95562 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SFT2D2O95562 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SFT2D2O95562 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SFT2D2O95562 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SFT2D2O95562 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SFT2D2O95562 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SFT2D2O95562 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SFT2D2O95562 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SFT2D2O95562 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SFT2D2O95562 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SFT2D2O95562 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SFT2D2O95562 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SFT2D2O95562 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SFT2D2O95562 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SFT2D2O95562 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SFT2D2O95562 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SFT2D2O95562 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SFT2D2O95562 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SFT2D2O95562 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SFT2D2O95562 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SFT2D2O95562 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SFT2D2O95562 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SFT2D2O95562 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SFT2D2O95562 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SFT2D2O95562 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SFT2D2O95562 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SFT2D2O95562 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SFT2D2O95562 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SFT2D2O95562 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.6 ms