Protein–RNA interactions for Protein: O60486

PLXNC1, Plexin-C1, humanhuman

Predictions only

Length 1,568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLXNC1O60486 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PLXNC1O60486 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC27.54■■■□□ 2
PLXNC1O60486 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PLXNC1O60486 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
PLXNC1O60486 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PLXNC1O60486 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC27.54■■■□□ 2
PLXNC1O60486 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
PLXNC1O60486 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
PLXNC1O60486 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC27.54■■■□□ 2
PLXNC1O60486 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PLXNC1O60486 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC27.54■■■□□ 2
PLXNC1O60486 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
PLXNC1O60486 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PLXNC1O60486 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PLXNC1O60486 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
PLXNC1O60486 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PLXNC1O60486 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PLXNC1O60486 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC27.53■■■□□ 2
PLXNC1O60486 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC27.53■■■□□ 2
PLXNC1O60486 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
PLXNC1O60486 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PLXNC1O60486 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
PLXNC1O60486 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
PLXNC1O60486 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PLXNC1O60486 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
PLXNC1O60486 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PLXNC1O60486 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PLXNC1O60486 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
PLXNC1O60486 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PLXNC1O60486 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PLXNC1O60486 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
PLXNC1O60486 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PLXNC1O60486 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PLXNC1O60486 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
PLXNC1O60486 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
PLXNC1O60486 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
PLXNC1O60486 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC27.52■■■□□ 2
PLXNC1O60486 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PLXNC1O60486 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC27.52■■■□□ 2
PLXNC1O60486 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC27.52■■■□□ 2
PLXNC1O60486 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
PLXNC1O60486 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
PLXNC1O60486 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PLXNC1O60486 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
PLXNC1O60486 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
PLXNC1O60486 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PLXNC1O60486 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PLXNC1O60486 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PLXNC1O60486 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PLXNC1O60486 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PLXNC1O60486 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PLXNC1O60486 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PLXNC1O60486 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
PLXNC1O60486 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
PLXNC1O60486 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
PLXNC1O60486 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC27.52■■■□□ 2
PLXNC1O60486 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
PLXNC1O60486 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PLXNC1O60486 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PLXNC1O60486 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PLXNC1O60486 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PLXNC1O60486 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PLXNC1O60486 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PLXNC1O60486 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PLXNC1O60486 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PLXNC1O60486 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PLXNC1O60486 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PLXNC1O60486 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PLXNC1O60486 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PLXNC1O60486 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PLXNC1O60486 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
PLXNC1O60486 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PLXNC1O60486 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PLXNC1O60486 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PLXNC1O60486 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PLXNC1O60486 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PLXNC1O60486 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PLXNC1O60486 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PLXNC1O60486 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PLXNC1O60486 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PLXNC1O60486 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PLXNC1O60486 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PLXNC1O60486 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PLXNC1O60486 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PLXNC1O60486 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PLXNC1O60486 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PLXNC1O60486 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
PLXNC1O60486 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PLXNC1O60486 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PLXNC1O60486 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PLXNC1O60486 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PLXNC1O60486 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PLXNC1O60486 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PLXNC1O60486 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PLXNC1O60486 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PLXNC1O60486 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PLXNC1O60486 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PLXNC1O60486 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PLXNC1O60486 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PLXNC1O60486 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms