Protein–RNA interactions for Protein: O43909

EXTL3, Exostosin-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXTL3O43909 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
EXTL3O43909 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
EXTL3O43909 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
EXTL3O43909 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
EXTL3O43909 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
EXTL3O43909 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
EXTL3O43909 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
EXTL3O43909 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
EXTL3O43909 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
EXTL3O43909 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
EXTL3O43909 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
EXTL3O43909 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
EXTL3O43909 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
EXTL3O43909 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
EXTL3O43909 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
EXTL3O43909 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
EXTL3O43909 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
EXTL3O43909 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
EXTL3O43909 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
EXTL3O43909 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
EXTL3O43909 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
EXTL3O43909 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
EXTL3O43909 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
EXTL3O43909 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
EXTL3O43909 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
EXTL3O43909 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
EXTL3O43909 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
EXTL3O43909 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
EXTL3O43909 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
EXTL3O43909 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
EXTL3O43909 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
EXTL3O43909 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
EXTL3O43909 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
EXTL3O43909 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
EXTL3O43909 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
EXTL3O43909 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
EXTL3O43909 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
EXTL3O43909 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
EXTL3O43909 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
EXTL3O43909 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
EXTL3O43909 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
EXTL3O43909 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
EXTL3O43909 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
EXTL3O43909 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
EXTL3O43909 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
EXTL3O43909 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
EXTL3O43909 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
EXTL3O43909 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
EXTL3O43909 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
EXTL3O43909 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
EXTL3O43909 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
EXTL3O43909 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
EXTL3O43909 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
EXTL3O43909 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
EXTL3O43909 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
EXTL3O43909 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
EXTL3O43909 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
EXTL3O43909 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
EXTL3O43909 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
EXTL3O43909 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
EXTL3O43909 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
EXTL3O43909 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
EXTL3O43909 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
EXTL3O43909 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
EXTL3O43909 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
EXTL3O43909 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
EXTL3O43909 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
EXTL3O43909 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
EXTL3O43909 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
EXTL3O43909 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
EXTL3O43909 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
EXTL3O43909 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
EXTL3O43909 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
EXTL3O43909 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
EXTL3O43909 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
EXTL3O43909 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
EXTL3O43909 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
EXTL3O43909 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
EXTL3O43909 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
EXTL3O43909 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
EXTL3O43909 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
EXTL3O43909 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
EXTL3O43909 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
EXTL3O43909 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
EXTL3O43909 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
EXTL3O43909 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
EXTL3O43909 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
EXTL3O43909 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
EXTL3O43909 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
EXTL3O43909 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
EXTL3O43909 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
EXTL3O43909 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
EXTL3O43909 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
EXTL3O43909 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
EXTL3O43909 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
EXTL3O43909 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
EXTL3O43909 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
EXTL3O43909 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
EXTL3O43909 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
EXTL3O43909 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms