Protein–RNA interactions for Protein: O43524

FOXO3, Forkhead box protein O3, humanhuman

Predictions only

Length 673 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXO3O43524 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
FOXO3O43524 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
FOXO3O43524 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
FOXO3O43524 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
FOXO3O43524 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
FOXO3O43524 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
FOXO3O43524 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
FOXO3O43524 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
FOXO3O43524 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
FOXO3O43524 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC25.3■■□□□ 1.64
FOXO3O43524 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
FOXO3O43524 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
FOXO3O43524 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
FOXO3O43524 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
FOXO3O43524 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
FOXO3O43524 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
FOXO3O43524 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
FOXO3O43524 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
FOXO3O43524 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
FOXO3O43524 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
FOXO3O43524 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
FOXO3O43524 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
FOXO3O43524 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
FOXO3O43524 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
FOXO3O43524 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
FOXO3O43524 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
FOXO3O43524 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
FOXO3O43524 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
FOXO3O43524 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
FOXO3O43524 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
FOXO3O43524 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
FOXO3O43524 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
FOXO3O43524 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
FOXO3O43524 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
FOXO3O43524 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
FOXO3O43524 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
FOXO3O43524 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
FOXO3O43524 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
FOXO3O43524 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
FOXO3O43524 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
FOXO3O43524 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
FOXO3O43524 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
FOXO3O43524 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
FOXO3O43524 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
FOXO3O43524 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
FOXO3O43524 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
FOXO3O43524 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
FOXO3O43524 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
FOXO3O43524 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
FOXO3O43524 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
FOXO3O43524 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
FOXO3O43524 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
FOXO3O43524 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
FOXO3O43524 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
FOXO3O43524 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
FOXO3O43524 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
FOXO3O43524 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
FOXO3O43524 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
FOXO3O43524 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
FOXO3O43524 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
FOXO3O43524 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
FOXO3O43524 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
FOXO3O43524 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
FOXO3O43524 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
FOXO3O43524 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
FOXO3O43524 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
FOXO3O43524 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
FOXO3O43524 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
FOXO3O43524 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
FOXO3O43524 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
FOXO3O43524 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
FOXO3O43524 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
FOXO3O43524 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
FOXO3O43524 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
FOXO3O43524 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
FOXO3O43524 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
FOXO3O43524 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
FOXO3O43524 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
FOXO3O43524 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
FOXO3O43524 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC25.26■■□□□ 1.63
FOXO3O43524 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
FOXO3O43524 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
FOXO3O43524 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
FOXO3O43524 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
FOXO3O43524 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
FOXO3O43524 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
FOXO3O43524 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
FOXO3O43524 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
FOXO3O43524 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
FOXO3O43524 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
FOXO3O43524 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
FOXO3O43524 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
FOXO3O43524 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
FOXO3O43524 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
FOXO3O43524 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
FOXO3O43524 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
FOXO3O43524 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
FOXO3O43524 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
FOXO3O43524 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
FOXO3O43524 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms