Protein–RNA interactions for Protein: O43395

PRPF3, U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF3O43395 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
PRPF3O43395 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PRPF3O43395 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PRPF3O43395 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PRPF3O43395 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PRPF3O43395 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRPF3O43395 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRPF3O43395 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRPF3O43395 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRPF3O43395 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRPF3O43395 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRPF3O43395 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRPF3O43395 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRPF3O43395 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRPF3O43395 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRPF3O43395 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRPF3O43395 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRPF3O43395 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRPF3O43395 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRPF3O43395 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRPF3O43395 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRPF3O43395 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRPF3O43395 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRPF3O43395 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRPF3O43395 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
PRPF3O43395 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRPF3O43395 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
PRPF3O43395 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
PRPF3O43395 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRPF3O43395 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRPF3O43395 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRPF3O43395 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRPF3O43395 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRPF3O43395 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRPF3O43395 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRPF3O43395 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRPF3O43395 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRPF3O43395 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRPF3O43395 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRPF3O43395 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRPF3O43395 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRPF3O43395 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRPF3O43395 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRPF3O43395 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
PRPF3O43395 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRPF3O43395 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
PRPF3O43395 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
PRPF3O43395 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
PRPF3O43395 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRPF3O43395 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRPF3O43395 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRPF3O43395 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRPF3O43395 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRPF3O43395 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRPF3O43395 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRPF3O43395 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRPF3O43395 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
PRPF3O43395 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRPF3O43395 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRPF3O43395 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRPF3O43395 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PRPF3O43395 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PRPF3O43395 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PRPF3O43395 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PRPF3O43395 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PRPF3O43395 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PRPF3O43395 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PRPF3O43395 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PRPF3O43395 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PRPF3O43395 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PRPF3O43395 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PRPF3O43395 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
PRPF3O43395 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PRPF3O43395 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
PRPF3O43395 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PRPF3O43395 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PRPF3O43395 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PRPF3O43395 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PRPF3O43395 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PRPF3O43395 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRPF3O43395 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRPF3O43395 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRPF3O43395 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRPF3O43395 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
PRPF3O43395 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRPF3O43395 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRPF3O43395 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRPF3O43395 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
PRPF3O43395 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRPF3O43395 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRPF3O43395 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
PRPF3O43395 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
PRPF3O43395 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRPF3O43395 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRPF3O43395 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRPF3O43395 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRPF3O43395 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
PRPF3O43395 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRPF3O43395 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRPF3O43395 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms