Protein–RNA interactions for Protein: O43157

PLXNB1, Plexin-B1, humanhuman

Predictions only

Length 2,135 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLXNB1O43157 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PLXNB1O43157 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
PLXNB1O43157 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
PLXNB1O43157 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
PLXNB1O43157 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
PLXNB1O43157 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
PLXNB1O43157 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PLXNB1O43157 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
PLXNB1O43157 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
PLXNB1O43157 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
PLXNB1O43157 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
PLXNB1O43157 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
PLXNB1O43157 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
PLXNB1O43157 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PLXNB1O43157 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
PLXNB1O43157 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
PLXNB1O43157 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PLXNB1O43157 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
PLXNB1O43157 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
PLXNB1O43157 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
PLXNB1O43157 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC14.96□□□□□ -0.01
PLXNB1O43157 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
PLXNB1O43157 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PLXNB1O43157 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PLXNB1O43157 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
PLXNB1O43157 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
PLXNB1O43157 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
PLXNB1O43157 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
PLXNB1O43157 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PLXNB1O43157 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PLXNB1O43157 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PLXNB1O43157 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PLXNB1O43157 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PLXNB1O43157 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PLXNB1O43157 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
PLXNB1O43157 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PLXNB1O43157 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PLXNB1O43157 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
PLXNB1O43157 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PLXNB1O43157 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PLXNB1O43157 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PLXNB1O43157 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PLXNB1O43157 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PLXNB1O43157 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PLXNB1O43157 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PLXNB1O43157 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PLXNB1O43157 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PLXNB1O43157 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PLXNB1O43157 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PLXNB1O43157 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PLXNB1O43157 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PLXNB1O43157 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PLXNB1O43157 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PLXNB1O43157 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PLXNB1O43157 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
PLXNB1O43157 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PLXNB1O43157 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
PLXNB1O43157 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PLXNB1O43157 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PLXNB1O43157 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PLXNB1O43157 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PLXNB1O43157 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PLXNB1O43157 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PLXNB1O43157 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PLXNB1O43157 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PLXNB1O43157 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PLXNB1O43157 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PLXNB1O43157 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PLXNB1O43157 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PLXNB1O43157 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PLXNB1O43157 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PLXNB1O43157 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PLXNB1O43157 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PLXNB1O43157 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
PLXNB1O43157 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PLXNB1O43157 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PLXNB1O43157 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
PLXNB1O43157 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PLXNB1O43157 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
PLXNB1O43157 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PLXNB1O43157 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PLXNB1O43157 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PLXNB1O43157 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PLXNB1O43157 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PLXNB1O43157 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PLXNB1O43157 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PLXNB1O43157 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PLXNB1O43157 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PLXNB1O43157 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PLXNB1O43157 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PLXNB1O43157 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PLXNB1O43157 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PLXNB1O43157 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
PLXNB1O43157 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PLXNB1O43157 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PLXNB1O43157 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PLXNB1O43157 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PLXNB1O43157 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PLXNB1O43157 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PLXNB1O43157 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.2 ms