Protein–RNA interactions for Protein: O00161

SNAP23, Synaptosomal-associated protein 23, humanhuman

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAP23O00161 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SNAP23O00161 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SNAP23O00161 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
SNAP23O00161 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SNAP23O00161 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SNAP23O00161 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SNAP23O00161 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SNAP23O00161 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SNAP23O00161 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SNAP23O00161 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SNAP23O00161 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SNAP23O00161 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SNAP23O00161 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SNAP23O00161 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SNAP23O00161 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SNAP23O00161 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SNAP23O00161 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SNAP23O00161 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SNAP23O00161 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SNAP23O00161 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SNAP23O00161 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SNAP23O00161 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SNAP23O00161 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SNAP23O00161 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SNAP23O00161 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SNAP23O00161 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SNAP23O00161 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SNAP23O00161 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SNAP23O00161 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SNAP23O00161 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SNAP23O00161 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SNAP23O00161 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SNAP23O00161 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SNAP23O00161 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SNAP23O00161 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SNAP23O00161 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SNAP23O00161 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SNAP23O00161 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SNAP23O00161 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
SNAP23O00161 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SNAP23O00161 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SNAP23O00161 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
SNAP23O00161 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SNAP23O00161 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SNAP23O00161 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SNAP23O00161 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SNAP23O00161 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SNAP23O00161 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SNAP23O00161 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SNAP23O00161 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SNAP23O00161 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SNAP23O00161 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SNAP23O00161 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SNAP23O00161 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SNAP23O00161 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SNAP23O00161 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SNAP23O00161 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SNAP23O00161 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SNAP23O00161 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SNAP23O00161 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SNAP23O00161 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SNAP23O00161 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SNAP23O00161 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
SNAP23O00161 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SNAP23O00161 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SNAP23O00161 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
SNAP23O00161 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
SNAP23O00161 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
SNAP23O00161 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SNAP23O00161 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SNAP23O00161 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
SNAP23O00161 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SNAP23O00161 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SNAP23O00161 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SNAP23O00161 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SNAP23O00161 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
SNAP23O00161 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SNAP23O00161 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SNAP23O00161 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SNAP23O00161 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SNAP23O00161 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SNAP23O00161 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
SNAP23O00161 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SNAP23O00161 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SNAP23O00161 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SNAP23O00161 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SNAP23O00161 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
SNAP23O00161 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SNAP23O00161 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SNAP23O00161 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SNAP23O00161 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SNAP23O00161 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SNAP23O00161 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SNAP23O00161 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
SNAP23O00161 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
SNAP23O00161 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SNAP23O00161 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SNAP23O00161 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SNAP23O00161 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
SNAP23O00161 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms