Protein–RNA interactions for Protein: J3KSC0

LINC01387, Putative uncharacterized protein encoded by LINC01387, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01387J3KSC0 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
LINC01387J3KSC0 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
LINC01387J3KSC0 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
LINC01387J3KSC0 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
LINC01387J3KSC0 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LINC01387J3KSC0 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LINC01387J3KSC0 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
LINC01387J3KSC0 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LINC01387J3KSC0 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
LINC01387J3KSC0 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LINC01387J3KSC0 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LINC01387J3KSC0 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
LINC01387J3KSC0 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LINC01387J3KSC0 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LINC01387J3KSC0 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
LINC01387J3KSC0 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
LINC01387J3KSC0 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
LINC01387J3KSC0 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
LINC01387J3KSC0 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
LINC01387J3KSC0 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
LINC01387J3KSC0 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
LINC01387J3KSC0 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
LINC01387J3KSC0 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
LINC01387J3KSC0 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LINC01387J3KSC0 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LINC01387J3KSC0 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LINC01387J3KSC0 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LINC01387J3KSC0 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LINC01387J3KSC0 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LINC01387J3KSC0 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LINC01387J3KSC0 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
LINC01387J3KSC0 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LINC01387J3KSC0 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LINC01387J3KSC0 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
LINC01387J3KSC0 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
LINC01387J3KSC0 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LINC01387J3KSC0 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LINC01387J3KSC0 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LINC01387J3KSC0 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LINC01387J3KSC0 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
LINC01387J3KSC0 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LINC01387J3KSC0 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
LINC01387J3KSC0 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
LINC01387J3KSC0 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LINC01387J3KSC0 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LINC01387J3KSC0 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
LINC01387J3KSC0 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
LINC01387J3KSC0 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
LINC01387J3KSC0 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LINC01387J3KSC0 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LINC01387J3KSC0 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LINC01387J3KSC0 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LINC01387J3KSC0 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LINC01387J3KSC0 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
LINC01387J3KSC0 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LINC01387J3KSC0 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
LINC01387J3KSC0 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LINC01387J3KSC0 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LINC01387J3KSC0 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LINC01387J3KSC0 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LINC01387J3KSC0 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
LINC01387J3KSC0 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LINC01387J3KSC0 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LINC01387J3KSC0 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LINC01387J3KSC0 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LINC01387J3KSC0 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LINC01387J3KSC0 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LINC01387J3KSC0 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LINC01387J3KSC0 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
LINC01387J3KSC0 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LINC01387J3KSC0 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LINC01387J3KSC0 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LINC01387J3KSC0 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LINC01387J3KSC0 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LINC01387J3KSC0 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LINC01387J3KSC0 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LINC01387J3KSC0 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LINC01387J3KSC0 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LINC01387J3KSC0 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LINC01387J3KSC0 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LINC01387J3KSC0 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LINC01387J3KSC0 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
LINC01387J3KSC0 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LINC01387J3KSC0 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LINC01387J3KSC0 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LINC01387J3KSC0 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LINC01387J3KSC0 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LINC01387J3KSC0 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
LINC01387J3KSC0 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LINC01387J3KSC0 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LINC01387J3KSC0 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LINC01387J3KSC0 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LINC01387J3KSC0 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LINC01387J3KSC0 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LINC01387J3KSC0 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LINC01387J3KSC0 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LINC01387J3KSC0 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LINC01387J3KSC0 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LINC01387J3KSC0 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LINC01387J3KSC0 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.2 ms