Protein–RNA interactions for Protein: H3BVE0

BOLA2-SMG1P6, BOLA2-SMG1P6 readthrough (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TRIM45-201ENST00000256649 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms