Protein–RNA interactions for Protein: E9PBE3

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E9PBE3 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
E9PBE3 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
E9PBE3 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
E9PBE3 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
E9PBE3 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
E9PBE3 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
E9PBE3 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
E9PBE3 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
E9PBE3 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
E9PBE3 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
E9PBE3 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
E9PBE3 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
E9PBE3 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
E9PBE3 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
E9PBE3 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
E9PBE3 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
E9PBE3 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
E9PBE3 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
E9PBE3 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
E9PBE3 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
E9PBE3 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
E9PBE3 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
E9PBE3 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
E9PBE3 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
E9PBE3 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
E9PBE3 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
E9PBE3 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
E9PBE3 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
E9PBE3 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
E9PBE3 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
E9PBE3 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
E9PBE3 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
E9PBE3 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
E9PBE3 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
E9PBE3 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
E9PBE3 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
E9PBE3 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
E9PBE3 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
E9PBE3 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
E9PBE3 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
E9PBE3 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
E9PBE3 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
E9PBE3 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
E9PBE3 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
E9PBE3 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
E9PBE3 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
E9PBE3 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
E9PBE3 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
E9PBE3 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
E9PBE3 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
E9PBE3 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
E9PBE3 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
E9PBE3 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
E9PBE3 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
E9PBE3 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
E9PBE3 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
E9PBE3 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
E9PBE3 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
E9PBE3 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
E9PBE3 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
E9PBE3 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
E9PBE3 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
E9PBE3 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
E9PBE3 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
E9PBE3 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
E9PBE3 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
E9PBE3 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
E9PBE3 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
E9PBE3 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
E9PBE3 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
E9PBE3 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
E9PBE3 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
E9PBE3 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
E9PBE3 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
E9PBE3 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
E9PBE3 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
E9PBE3 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
E9PBE3 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
E9PBE3 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
E9PBE3 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
E9PBE3 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
E9PBE3 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
E9PBE3 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
E9PBE3 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
E9PBE3 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
E9PBE3 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
E9PBE3 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
E9PBE3 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC18.14■□□□□ 0.5
E9PBE3 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
E9PBE3 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
E9PBE3 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
E9PBE3 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.5
E9PBE3 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
E9PBE3 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
E9PBE3 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
E9PBE3 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
E9PBE3 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
E9PBE3 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
E9PBE3 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
E9PBE3 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.7 ms