Protein–RNA interactions for Protein: C9JLJ4

USP17L13, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L13C9JLJ4 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
USP17L13C9JLJ4 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
USP17L13C9JLJ4 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
USP17L13C9JLJ4 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
USP17L13C9JLJ4 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
USP17L13C9JLJ4 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
USP17L13C9JLJ4 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
USP17L13C9JLJ4 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
USP17L13C9JLJ4 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
USP17L13C9JLJ4 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
USP17L13C9JLJ4 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
USP17L13C9JLJ4 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
USP17L13C9JLJ4 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
USP17L13C9JLJ4 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
USP17L13C9JLJ4 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
USP17L13C9JLJ4 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
USP17L13C9JLJ4 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
USP17L13C9JLJ4 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
USP17L13C9JLJ4 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
USP17L13C9JLJ4 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
USP17L13C9JLJ4 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
USP17L13C9JLJ4 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
USP17L13C9JLJ4 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
USP17L13C9JLJ4 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
USP17L13C9JLJ4 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
USP17L13C9JLJ4 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
USP17L13C9JLJ4 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
USP17L13C9JLJ4 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
USP17L13C9JLJ4 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
USP17L13C9JLJ4 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
USP17L13C9JLJ4 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
USP17L13C9JLJ4 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
USP17L13C9JLJ4 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
USP17L13C9JLJ4 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
USP17L13C9JLJ4 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
USP17L13C9JLJ4 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
USP17L13C9JLJ4 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
USP17L13C9JLJ4 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
USP17L13C9JLJ4 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
USP17L13C9JLJ4 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
USP17L13C9JLJ4 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
USP17L13C9JLJ4 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
USP17L13C9JLJ4 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
USP17L13C9JLJ4 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
USP17L13C9JLJ4 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
USP17L13C9JLJ4 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
USP17L13C9JLJ4 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
USP17L13C9JLJ4 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
USP17L13C9JLJ4 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
USP17L13C9JLJ4 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
USP17L13C9JLJ4 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
USP17L13C9JLJ4 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
USP17L13C9JLJ4 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
USP17L13C9JLJ4 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
USP17L13C9JLJ4 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
USP17L13C9JLJ4 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
USP17L13C9JLJ4 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
USP17L13C9JLJ4 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.04
USP17L13C9JLJ4 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.04
USP17L13C9JLJ4 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
USP17L13C9JLJ4 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
USP17L13C9JLJ4 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
USP17L13C9JLJ4 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
USP17L13C9JLJ4 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
USP17L13C9JLJ4 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
USP17L13C9JLJ4 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
USP17L13C9JLJ4 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
USP17L13C9JLJ4 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.03
USP17L13C9JLJ4 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
USP17L13C9JLJ4 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
USP17L13C9JLJ4 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
USP17L13C9JLJ4 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
USP17L13C9JLJ4 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
USP17L13C9JLJ4 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
USP17L13C9JLJ4 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
USP17L13C9JLJ4 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
USP17L13C9JLJ4 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
USP17L13C9JLJ4 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
USP17L13C9JLJ4 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
USP17L13C9JLJ4 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
USP17L13C9JLJ4 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
USP17L13C9JLJ4 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
USP17L13C9JLJ4 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
USP17L13C9JLJ4 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
USP17L13C9JLJ4 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
USP17L13C9JLJ4 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
USP17L13C9JLJ4 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
USP17L13C9JLJ4 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
USP17L13C9JLJ4 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
USP17L13C9JLJ4 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
USP17L13C9JLJ4 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
USP17L13C9JLJ4 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
USP17L13C9JLJ4 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
USP17L13C9JLJ4 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
USP17L13C9JLJ4 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
USP17L13C9JLJ4 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
USP17L13C9JLJ4 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
USP17L13C9JLJ4 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
USP17L13C9JLJ4 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
USP17L13C9JLJ4 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms