Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH8

ERVV-1, Endogenous retrovirus group V member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-1B6SEH8 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ERVV-1B6SEH8 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ERVV-1B6SEH8 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ERVV-1B6SEH8 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ERVV-1B6SEH8 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ERVV-1B6SEH8 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ERVV-1B6SEH8 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ERVV-1B6SEH8 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ERVV-1B6SEH8 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ERVV-1B6SEH8 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ERVV-1B6SEH8 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
ERVV-1B6SEH8 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ERVV-1B6SEH8 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ERVV-1B6SEH8 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ERVV-1B6SEH8 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
ERVV-1B6SEH8 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ERVV-1B6SEH8 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ERVV-1B6SEH8 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ERVV-1B6SEH8 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ERVV-1B6SEH8 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ERVV-1B6SEH8 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ERVV-1B6SEH8 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ERVV-1B6SEH8 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ERVV-1B6SEH8 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
ERVV-1B6SEH8 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ERVV-1B6SEH8 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ERVV-1B6SEH8 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ERVV-1B6SEH8 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ERVV-1B6SEH8 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ERVV-1B6SEH8 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ERVV-1B6SEH8 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ERVV-1B6SEH8 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ERVV-1B6SEH8 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ERVV-1B6SEH8 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ERVV-1B6SEH8 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ERVV-1B6SEH8 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ERVV-1B6SEH8 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ERVV-1B6SEH8 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ERVV-1B6SEH8 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ERVV-1B6SEH8 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ERVV-1B6SEH8 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ERVV-1B6SEH8 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
ERVV-1B6SEH8 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ERVV-1B6SEH8 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
ERVV-1B6SEH8 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ERVV-1B6SEH8 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ERVV-1B6SEH8 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ERVV-1B6SEH8 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ERVV-1B6SEH8 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ERVV-1B6SEH8 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ERVV-1B6SEH8 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ERVV-1B6SEH8 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ERVV-1B6SEH8 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ERVV-1B6SEH8 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ERVV-1B6SEH8 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ERVV-1B6SEH8 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ERVV-1B6SEH8 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ERVV-1B6SEH8 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ERVV-1B6SEH8 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ERVV-1B6SEH8 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ERVV-1B6SEH8 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ERVV-1B6SEH8 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ERVV-1B6SEH8 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ERVV-1B6SEH8 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
ERVV-1B6SEH8 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ERVV-1B6SEH8 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
ERVV-1B6SEH8 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ERVV-1B6SEH8 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ERVV-1B6SEH8 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ERVV-1B6SEH8 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ERVV-1B6SEH8 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ERVV-1B6SEH8 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ERVV-1B6SEH8 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ERVV-1B6SEH8 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ERVV-1B6SEH8 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ERVV-1B6SEH8 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ERVV-1B6SEH8 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ERVV-1B6SEH8 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ERVV-1B6SEH8 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ERVV-1B6SEH8 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ERVV-1B6SEH8 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
ERVV-1B6SEH8 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ERVV-1B6SEH8 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
ERVV-1B6SEH8 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ERVV-1B6SEH8 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ERVV-1B6SEH8 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ERVV-1B6SEH8 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
ERVV-1B6SEH8 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ERVV-1B6SEH8 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ERVV-1B6SEH8 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ERVV-1B6SEH8 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ERVV-1B6SEH8 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ERVV-1B6SEH8 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ERVV-1B6SEH8 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ERVV-1B6SEH8 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ERVV-1B6SEH8 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ERVV-1B6SEH8 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ERVV-1B6SEH8 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ERVV-1B6SEH8 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ERVV-1B6SEH8 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms