Protein–RNA interactions for Protein: B4DU55

ZNF879, Zinc finger protein 879, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF879B4DU55 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ZNF879B4DU55 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
ZNF879B4DU55 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ZNF879B4DU55 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ZNF879B4DU55 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ZNF879B4DU55 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
ZNF879B4DU55 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ZNF879B4DU55 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ZNF879B4DU55 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ZNF879B4DU55 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ZNF879B4DU55 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ZNF879B4DU55 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ZNF879B4DU55 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ZNF879B4DU55 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ZNF879B4DU55 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ZNF879B4DU55 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ZNF879B4DU55 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ZNF879B4DU55 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ZNF879B4DU55 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ZNF879B4DU55 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ZNF879B4DU55 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ZNF879B4DU55 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ZNF879B4DU55 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ZNF879B4DU55 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
ZNF879B4DU55 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ZNF879B4DU55 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ZNF879B4DU55 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ZNF879B4DU55 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
ZNF879B4DU55 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ZNF879B4DU55 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ZNF879B4DU55 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ZNF879B4DU55 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ZNF879B4DU55 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ZNF879B4DU55 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
ZNF879B4DU55 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ZNF879B4DU55 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ZNF879B4DU55 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ZNF879B4DU55 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ZNF879B4DU55 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ZNF879B4DU55 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ZNF879B4DU55 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ZNF879B4DU55 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ZNF879B4DU55 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ZNF879B4DU55 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ZNF879B4DU55 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ZNF879B4DU55 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
ZNF879B4DU55 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ZNF879B4DU55 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ZNF879B4DU55 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ZNF879B4DU55 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZNF879B4DU55 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZNF879B4DU55 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZNF879B4DU55 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZNF879B4DU55 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
ZNF879B4DU55 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZNF879B4DU55 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZNF879B4DU55 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZNF879B4DU55 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZNF879B4DU55 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZNF879B4DU55 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZNF879B4DU55 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZNF879B4DU55 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZNF879B4DU55 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZNF879B4DU55 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZNF879B4DU55 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZNF879B4DU55 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZNF879B4DU55 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZNF879B4DU55 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZNF879B4DU55 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZNF879B4DU55 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZNF879B4DU55 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZNF879B4DU55 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZNF879B4DU55 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZNF879B4DU55 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZNF879B4DU55 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZNF879B4DU55 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZNF879B4DU55 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZNF879B4DU55 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZNF879B4DU55 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZNF879B4DU55 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZNF879B4DU55 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZNF879B4DU55 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZNF879B4DU55 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZNF879B4DU55 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZNF879B4DU55 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZNF879B4DU55 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ZNF879B4DU55 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ZNF879B4DU55 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ZNF879B4DU55 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ZNF879B4DU55 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ZNF879B4DU55 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ZNF879B4DU55 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ZNF879B4DU55 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ZNF879B4DU55 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ZNF879B4DU55 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ZNF879B4DU55 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ZNF879B4DU55 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ZNF879B4DU55 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ZNF879B4DU55 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ZNF879B4DU55 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.5 ms