Protein–RNA interactions for Protein: A8MQ27

NEURL1B, E3 ubiquitin-protein ligase NEURL1B, humanhuman

Predictions only

Length 555 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEURL1BA8MQ27 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NEURL1BA8MQ27 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NEURL1BA8MQ27 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NEURL1BA8MQ27 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NEURL1BA8MQ27 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
NEURL1BA8MQ27 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NEURL1BA8MQ27 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NEURL1BA8MQ27 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NEURL1BA8MQ27 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NEURL1BA8MQ27 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NEURL1BA8MQ27 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NEURL1BA8MQ27 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NEURL1BA8MQ27 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NEURL1BA8MQ27 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NEURL1BA8MQ27 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NEURL1BA8MQ27 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NEURL1BA8MQ27 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NEURL1BA8MQ27 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NEURL1BA8MQ27 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NEURL1BA8MQ27 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NEURL1BA8MQ27 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NEURL1BA8MQ27 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
NEURL1BA8MQ27 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NEURL1BA8MQ27 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NEURL1BA8MQ27 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NEURL1BA8MQ27 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NEURL1BA8MQ27 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NEURL1BA8MQ27 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NEURL1BA8MQ27 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NEURL1BA8MQ27 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NEURL1BA8MQ27 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NEURL1BA8MQ27 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NEURL1BA8MQ27 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NEURL1BA8MQ27 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NEURL1BA8MQ27 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NEURL1BA8MQ27 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NEURL1BA8MQ27 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NEURL1BA8MQ27 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
NEURL1BA8MQ27 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
NEURL1BA8MQ27 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NEURL1BA8MQ27 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NEURL1BA8MQ27 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NEURL1BA8MQ27 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NEURL1BA8MQ27 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NEURL1BA8MQ27 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NEURL1BA8MQ27 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
NEURL1BA8MQ27 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
NEURL1BA8MQ27 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
NEURL1BA8MQ27 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
NEURL1BA8MQ27 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
NEURL1BA8MQ27 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
NEURL1BA8MQ27 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
NEURL1BA8MQ27 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
NEURL1BA8MQ27 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NEURL1BA8MQ27 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NEURL1BA8MQ27 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NEURL1BA8MQ27 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NEURL1BA8MQ27 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NEURL1BA8MQ27 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NEURL1BA8MQ27 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NEURL1BA8MQ27 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
NEURL1BA8MQ27 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NEURL1BA8MQ27 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
NEURL1BA8MQ27 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NEURL1BA8MQ27 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NEURL1BA8MQ27 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NEURL1BA8MQ27 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NEURL1BA8MQ27 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NEURL1BA8MQ27 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NEURL1BA8MQ27 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NEURL1BA8MQ27 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
NEURL1BA8MQ27 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NEURL1BA8MQ27 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NEURL1BA8MQ27 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NEURL1BA8MQ27 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NEURL1BA8MQ27 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
NEURL1BA8MQ27 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NEURL1BA8MQ27 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NEURL1BA8MQ27 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NEURL1BA8MQ27 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NEURL1BA8MQ27 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NEURL1BA8MQ27 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NEURL1BA8MQ27 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NEURL1BA8MQ27 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NEURL1BA8MQ27 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NEURL1BA8MQ27 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NEURL1BA8MQ27 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
NEURL1BA8MQ27 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NEURL1BA8MQ27 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NEURL1BA8MQ27 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NEURL1BA8MQ27 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NEURL1BA8MQ27 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NEURL1BA8MQ27 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NEURL1BA8MQ27 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NEURL1BA8MQ27 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NEURL1BA8MQ27 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NEURL1BA8MQ27 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NEURL1BA8MQ27 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
NEURL1BA8MQ27 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NEURL1BA8MQ27 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms