Protein–RNA interactions for Protein: A6NKF2

ARID3C, AT-rich interactive domain-containing protein 3C, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID3CA6NKF2 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
ARID3CA6NKF2 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
ARID3CA6NKF2 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
ARID3CA6NKF2 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
ARID3CA6NKF2 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
ARID3CA6NKF2 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
ARID3CA6NKF2 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
ARID3CA6NKF2 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
ARID3CA6NKF2 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
ARID3CA6NKF2 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
ARID3CA6NKF2 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
ARID3CA6NKF2 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.23
ARID3CA6NKF2 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
ARID3CA6NKF2 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
ARID3CA6NKF2 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
ARID3CA6NKF2 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
ARID3CA6NKF2 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
ARID3CA6NKF2 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
ARID3CA6NKF2 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.22
ARID3CA6NKF2 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
ARID3CA6NKF2 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
ARID3CA6NKF2 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
ARID3CA6NKF2 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
ARID3CA6NKF2 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
ARID3CA6NKF2 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
ARID3CA6NKF2 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
ARID3CA6NKF2 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
ARID3CA6NKF2 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
ARID3CA6NKF2 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
ARID3CA6NKF2 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
ARID3CA6NKF2 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
ARID3CA6NKF2 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
ARID3CA6NKF2 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
ARID3CA6NKF2 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC28.94■■■□□ 2.22
ARID3CA6NKF2 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
ARID3CA6NKF2 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
ARID3CA6NKF2 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
ARID3CA6NKF2 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC28.94■■■□□ 2.22
ARID3CA6NKF2 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
ARID3CA6NKF2 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC28.94■■■□□ 2.22
ARID3CA6NKF2 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
ARID3CA6NKF2 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
ARID3CA6NKF2 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
ARID3CA6NKF2 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
ARID3CA6NKF2 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
ARID3CA6NKF2 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
ARID3CA6NKF2 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
ARID3CA6NKF2 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
ARID3CA6NKF2 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
ARID3CA6NKF2 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
ARID3CA6NKF2 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
ARID3CA6NKF2 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
ARID3CA6NKF2 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
ARID3CA6NKF2 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
ARID3CA6NKF2 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
ARID3CA6NKF2 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
ARID3CA6NKF2 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
ARID3CA6NKF2 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
ARID3CA6NKF2 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
ARID3CA6NKF2 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
ARID3CA6NKF2 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
ARID3CA6NKF2 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
ARID3CA6NKF2 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
ARID3CA6NKF2 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
ARID3CA6NKF2 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
ARID3CA6NKF2 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
ARID3CA6NKF2 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
ARID3CA6NKF2 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
ARID3CA6NKF2 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
ARID3CA6NKF2 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
ARID3CA6NKF2 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
ARID3CA6NKF2 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
ARID3CA6NKF2 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
ARID3CA6NKF2 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
ARID3CA6NKF2 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
ARID3CA6NKF2 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
ARID3CA6NKF2 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
ARID3CA6NKF2 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
ARID3CA6NKF2 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
ARID3CA6NKF2 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
ARID3CA6NKF2 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
ARID3CA6NKF2 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
ARID3CA6NKF2 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
ARID3CA6NKF2 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
ARID3CA6NKF2 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
ARID3CA6NKF2 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
ARID3CA6NKF2 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
ARID3CA6NKF2 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
ARID3CA6NKF2 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
ARID3CA6NKF2 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
ARID3CA6NKF2 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
ARID3CA6NKF2 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
ARID3CA6NKF2 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
ARID3CA6NKF2 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
ARID3CA6NKF2 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
ARID3CA6NKF2 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
ARID3CA6NKF2 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
ARID3CA6NKF2 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
ARID3CA6NKF2 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
ARID3CA6NKF2 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.3 ms