Protein–RNA interactions for Protein: A6NCI5

LINC00862, Putative transmembrane protein encoded by LINC00862, humanhuman

Predictions only

Length 91 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00862A6NCI5 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC00862A6NCI5 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC00862A6NCI5 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC00862A6NCI5 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC00862A6NCI5 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC00862A6NCI5 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC00862A6NCI5 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC00862A6NCI5 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC00862A6NCI5 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC00862A6NCI5 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC00862A6NCI5 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC00862A6NCI5 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC00862A6NCI5 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC00862A6NCI5 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC00862A6NCI5 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC00862A6NCI5 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC00862A6NCI5 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC00862A6NCI5 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC00862A6NCI5 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC00862A6NCI5 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC00862A6NCI5 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC00862A6NCI5 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC00862A6NCI5 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC00862A6NCI5 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC00862A6NCI5 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC00862A6NCI5 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC00862A6NCI5 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC00862A6NCI5 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC00862A6NCI5 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC00862A6NCI5 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC00862A6NCI5 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC00862A6NCI5 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC00862A6NCI5 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC00862A6NCI5 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC00862A6NCI5 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC00862A6NCI5 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC00862A6NCI5 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC00862A6NCI5 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC00862A6NCI5 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC00862A6NCI5 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC00862A6NCI5 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC00862A6NCI5 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC00862A6NCI5 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC00862A6NCI5 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC00862A6NCI5 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC00862A6NCI5 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC00862A6NCI5 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC00862A6NCI5 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC00862A6NCI5 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC00862A6NCI5 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC00862A6NCI5 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC00862A6NCI5 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC00862A6NCI5 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC00862A6NCI5 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC00862A6NCI5 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC00862A6NCI5 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC00862A6NCI5 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC00862A6NCI5 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC00862A6NCI5 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC00862A6NCI5 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC00862A6NCI5 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC00862A6NCI5 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC00862A6NCI5 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC00862A6NCI5 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC00862A6NCI5 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC00862A6NCI5 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC00862A6NCI5 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC00862A6NCI5 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
LINC00862A6NCI5 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
LINC00862A6NCI5 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
LINC00862A6NCI5 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
LINC00862A6NCI5 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
LINC00862A6NCI5 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
LINC00862A6NCI5 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
LINC00862A6NCI5 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LINC00862A6NCI5 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LINC00862A6NCI5 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LINC00862A6NCI5 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
LINC00862A6NCI5 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC15.08■□□□□ 0
LINC00862A6NCI5 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC15.08■□□□□ 0
LINC00862A6NCI5 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC15.08■□□□□ 0
LINC00862A6NCI5 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LINC00862A6NCI5 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LINC00862A6NCI5 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
LINC00862A6NCI5 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
LINC00862A6NCI5 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
LINC00862A6NCI5 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LINC00862A6NCI5 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
LINC00862A6NCI5 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LINC00862A6NCI5 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LINC00862A6NCI5 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LINC00862A6NCI5 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LINC00862A6NCI5 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
LINC00862A6NCI5 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LINC00862A6NCI5 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LINC00862A6NCI5 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC15.07■□□□□ 0
LINC00862A6NCI5 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00862A6NCI5 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00862A6NCI5 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00862A6NCI5 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms