Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3B3

TMED7, Transmembrane emp24 domain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMED7Q9Y3B3 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TMED7Q9Y3B3 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TMED7Q9Y3B3 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TMED7Q9Y3B3 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TMED7Q9Y3B3 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
TMED7Q9Y3B3 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.3
TMED7Q9Y3B3 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
TMED7Q9Y3B3 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
TMED7Q9Y3B3 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.3
TMED7Q9Y3B3 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
TMED7Q9Y3B3 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TMED7Q9Y3B3 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TMED7Q9Y3B3 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
TMED7Q9Y3B3 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TMED7Q9Y3B3 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
TMED7Q9Y3B3 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TMED7Q9Y3B3 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TMED7Q9Y3B3 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TMED7Q9Y3B3 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TMED7Q9Y3B3 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TMED7Q9Y3B3 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TMED7Q9Y3B3 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TMED7Q9Y3B3 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TMED7Q9Y3B3 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TMED7Q9Y3B3 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TMED7Q9Y3B3 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TMED7Q9Y3B3 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TMED7Q9Y3B3 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TMED7Q9Y3B3 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TMED7Q9Y3B3 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TMED7Q9Y3B3 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TMED7Q9Y3B3 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TMED7Q9Y3B3 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TMED7Q9Y3B3 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
TMED7Q9Y3B3 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TMED7Q9Y3B3 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TMED7Q9Y3B3 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TMED7Q9Y3B3 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TMED7Q9Y3B3 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TMED7Q9Y3B3 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TMED7Q9Y3B3 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
TMED7Q9Y3B3 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
TMED7Q9Y3B3 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TMED7Q9Y3B3 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TMED7Q9Y3B3 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TMED7Q9Y3B3 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TMED7Q9Y3B3 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TMED7Q9Y3B3 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TMED7Q9Y3B3 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TMED7Q9Y3B3 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TMED7Q9Y3B3 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TMED7Q9Y3B3 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
TMED7Q9Y3B3 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TMED7Q9Y3B3 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TMED7Q9Y3B3 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TMED7Q9Y3B3 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TMED7Q9Y3B3 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TMED7Q9Y3B3 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TMED7Q9Y3B3 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TMED7Q9Y3B3 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TMED7Q9Y3B3 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TMED7Q9Y3B3 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TMED7Q9Y3B3 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
TMED7Q9Y3B3 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TMED7Q9Y3B3 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TMED7Q9Y3B3 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TMED7Q9Y3B3 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TMED7Q9Y3B3 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TMED7Q9Y3B3 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TMED7Q9Y3B3 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TMED7Q9Y3B3 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TMED7Q9Y3B3 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TMED7Q9Y3B3 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TMED7Q9Y3B3 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TMED7Q9Y3B3 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TMED7Q9Y3B3 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TMED7Q9Y3B3 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TMED7Q9Y3B3 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TMED7Q9Y3B3 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TMED7Q9Y3B3 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TMED7Q9Y3B3 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TMED7Q9Y3B3 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TMED7Q9Y3B3 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TMED7Q9Y3B3 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TMED7Q9Y3B3 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TMED7Q9Y3B3 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TMED7Q9Y3B3 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TMED7Q9Y3B3 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TMED7Q9Y3B3 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TMED7Q9Y3B3 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
TMED7Q9Y3B3 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TMED7Q9Y3B3 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TMED7Q9Y3B3 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TMED7Q9Y3B3 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TMED7Q9Y3B3 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TMED7Q9Y3B3 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TMED7Q9Y3B3 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TMED7Q9Y3B3 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TMED7Q9Y3B3 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
TMED7Q9Y3B3 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms