Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y376

CAB39, Calcium-binding protein 39, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 341 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAB39Q9Y376 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CAB39Q9Y376 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CAB39Q9Y376 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CAB39Q9Y376 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CAB39Q9Y376 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CAB39Q9Y376 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CAB39Q9Y376 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CAB39Q9Y376 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CAB39Q9Y376 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CAB39Q9Y376 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CAB39Q9Y376 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CAB39Q9Y376 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CAB39Q9Y376 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CAB39Q9Y376 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CAB39Q9Y376 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CAB39Q9Y376 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CAB39Q9Y376 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CAB39Q9Y376 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CAB39Q9Y376 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CAB39Q9Y376 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
CAB39Q9Y376 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CAB39Q9Y376 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CAB39Q9Y376 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CAB39Q9Y376 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CAB39Q9Y376 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CAB39Q9Y376 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CAB39Q9Y376 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CAB39Q9Y376 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CAB39Q9Y376 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CAB39Q9Y376 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CAB39Q9Y376 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CAB39Q9Y376 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CAB39Q9Y376 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CAB39Q9Y376 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CAB39Q9Y376 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CAB39Q9Y376 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CAB39Q9Y376 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CAB39Q9Y376 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CAB39Q9Y376 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CAB39Q9Y376 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CAB39Q9Y376 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CAB39Q9Y376 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CAB39Q9Y376 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CAB39Q9Y376 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CAB39Q9Y376 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CAB39Q9Y376 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CAB39Q9Y376 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CAB39Q9Y376 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CAB39Q9Y376 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CAB39Q9Y376 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CAB39Q9Y376 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CAB39Q9Y376 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CAB39Q9Y376 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CAB39Q9Y376 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CAB39Q9Y376 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CAB39Q9Y376 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CAB39Q9Y376 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CAB39Q9Y376 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CAB39Q9Y376 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CAB39Q9Y376 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CAB39Q9Y376 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CAB39Q9Y376 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CAB39Q9Y376 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CAB39Q9Y376 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CAB39Q9Y376 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CAB39Q9Y376 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CAB39Q9Y376 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CAB39Q9Y376 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CAB39Q9Y376 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CAB39Q9Y376 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CAB39Q9Y376 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CAB39Q9Y376 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CAB39Q9Y376 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CAB39Q9Y376 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CAB39Q9Y376 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CAB39Q9Y376 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CAB39Q9Y376 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CAB39Q9Y376 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CAB39Q9Y376 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CAB39Q9Y376 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CAB39Q9Y376 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CAB39Q9Y376 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CAB39Q9Y376 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CAB39Q9Y376 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CAB39Q9Y376 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CAB39Q9Y376 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CAB39Q9Y376 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CAB39Q9Y376 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CAB39Q9Y376 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CAB39Q9Y376 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CAB39Q9Y376 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CAB39Q9Y376 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CAB39Q9Y376 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CAB39Q9Y376 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CAB39Q9Y376 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CAB39Q9Y376 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CAB39Q9Y376 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CAB39Q9Y376 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CAB39Q9Y376 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CAB39Q9Y376 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms