Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2U8

LEMD3, Inner nuclear membrane protein Man1, humanhuman

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LEMD3Q9Y2U8 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
LEMD3Q9Y2U8 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
LEMD3Q9Y2U8 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
LEMD3Q9Y2U8 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
LEMD3Q9Y2U8 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LEMD3Q9Y2U8 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
LEMD3Q9Y2U8 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
LEMD3Q9Y2U8 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LEMD3Q9Y2U8 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LEMD3Q9Y2U8 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LEMD3Q9Y2U8 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LEMD3Q9Y2U8 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LEMD3Q9Y2U8 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LEMD3Q9Y2U8 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LEMD3Q9Y2U8 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LEMD3Q9Y2U8 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LEMD3Q9Y2U8 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LEMD3Q9Y2U8 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LEMD3Q9Y2U8 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LEMD3Q9Y2U8 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LEMD3Q9Y2U8 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
LEMD3Q9Y2U8 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LEMD3Q9Y2U8 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LEMD3Q9Y2U8 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LEMD3Q9Y2U8 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LEMD3Q9Y2U8 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LEMD3Q9Y2U8 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LEMD3Q9Y2U8 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LEMD3Q9Y2U8 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LEMD3Q9Y2U8 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LEMD3Q9Y2U8 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LEMD3Q9Y2U8 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LEMD3Q9Y2U8 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LEMD3Q9Y2U8 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LEMD3Q9Y2U8 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LEMD3Q9Y2U8 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LEMD3Q9Y2U8 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LEMD3Q9Y2U8 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LEMD3Q9Y2U8 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LEMD3Q9Y2U8 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LEMD3Q9Y2U8 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LEMD3Q9Y2U8 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LEMD3Q9Y2U8 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LEMD3Q9Y2U8 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LEMD3Q9Y2U8 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LEMD3Q9Y2U8 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LEMD3Q9Y2U8 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LEMD3Q9Y2U8 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LEMD3Q9Y2U8 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LEMD3Q9Y2U8 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LEMD3Q9Y2U8 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LEMD3Q9Y2U8 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LEMD3Q9Y2U8 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LEMD3Q9Y2U8 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
LEMD3Q9Y2U8 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LEMD3Q9Y2U8 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LEMD3Q9Y2U8 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LEMD3Q9Y2U8 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LEMD3Q9Y2U8 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LEMD3Q9Y2U8 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LEMD3Q9Y2U8 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LEMD3Q9Y2U8 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LEMD3Q9Y2U8 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LEMD3Q9Y2U8 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LEMD3Q9Y2U8 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LEMD3Q9Y2U8 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LEMD3Q9Y2U8 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LEMD3Q9Y2U8 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LEMD3Q9Y2U8 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LEMD3Q9Y2U8 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LEMD3Q9Y2U8 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LEMD3Q9Y2U8 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LEMD3Q9Y2U8 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LEMD3Q9Y2U8 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LEMD3Q9Y2U8 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
LEMD3Q9Y2U8 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LEMD3Q9Y2U8 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LEMD3Q9Y2U8 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LEMD3Q9Y2U8 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LEMD3Q9Y2U8 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LEMD3Q9Y2U8 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LEMD3Q9Y2U8 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LEMD3Q9Y2U8 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LEMD3Q9Y2U8 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LEMD3Q9Y2U8 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LEMD3Q9Y2U8 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LEMD3Q9Y2U8 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LEMD3Q9Y2U8 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LEMD3Q9Y2U8 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LEMD3Q9Y2U8 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LEMD3Q9Y2U8 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LEMD3Q9Y2U8 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
LEMD3Q9Y2U8 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LEMD3Q9Y2U8 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LEMD3Q9Y2U8 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LEMD3Q9Y2U8 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LEMD3Q9Y2U8 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LEMD3Q9Y2U8 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LEMD3Q9Y2U8 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LEMD3Q9Y2U8 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms