Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2T6

GPR55, G-protein coupled receptor 55, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 319 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPR55Q9Y2T6 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GPR55Q9Y2T6 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GPR55Q9Y2T6 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GPR55Q9Y2T6 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
GPR55Q9Y2T6 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GPR55Q9Y2T6 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GPR55Q9Y2T6 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GPR55Q9Y2T6 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GPR55Q9Y2T6 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GPR55Q9Y2T6 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GPR55Q9Y2T6 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GPR55Q9Y2T6 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GPR55Q9Y2T6 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GPR55Q9Y2T6 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GPR55Q9Y2T6 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GPR55Q9Y2T6 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GPR55Q9Y2T6 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GPR55Q9Y2T6 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
GPR55Q9Y2T6 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GPR55Q9Y2T6 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GPR55Q9Y2T6 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GPR55Q9Y2T6 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GPR55Q9Y2T6 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GPR55Q9Y2T6 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
GPR55Q9Y2T6 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GPR55Q9Y2T6 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GPR55Q9Y2T6 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GPR55Q9Y2T6 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GPR55Q9Y2T6 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GPR55Q9Y2T6 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GPR55Q9Y2T6 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GPR55Q9Y2T6 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GPR55Q9Y2T6 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GPR55Q9Y2T6 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GPR55Q9Y2T6 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GPR55Q9Y2T6 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
GPR55Q9Y2T6 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GPR55Q9Y2T6 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
GPR55Q9Y2T6 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GPR55Q9Y2T6 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GPR55Q9Y2T6 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
GPR55Q9Y2T6 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GPR55Q9Y2T6 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GPR55Q9Y2T6 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GPR55Q9Y2T6 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GPR55Q9Y2T6 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GPR55Q9Y2T6 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GPR55Q9Y2T6 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GPR55Q9Y2T6 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GPR55Q9Y2T6 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GPR55Q9Y2T6 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GPR55Q9Y2T6 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
GPR55Q9Y2T6 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
GPR55Q9Y2T6 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GPR55Q9Y2T6 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GPR55Q9Y2T6 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GPR55Q9Y2T6 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GPR55Q9Y2T6 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GPR55Q9Y2T6 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GPR55Q9Y2T6 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GPR55Q9Y2T6 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GPR55Q9Y2T6 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GPR55Q9Y2T6 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GPR55Q9Y2T6 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GPR55Q9Y2T6 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GPR55Q9Y2T6 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GPR55Q9Y2T6 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GPR55Q9Y2T6 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GPR55Q9Y2T6 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GPR55Q9Y2T6 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GPR55Q9Y2T6 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
GPR55Q9Y2T6 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GPR55Q9Y2T6 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GPR55Q9Y2T6 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GPR55Q9Y2T6 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GPR55Q9Y2T6 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GPR55Q9Y2T6 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GPR55Q9Y2T6 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GPR55Q9Y2T6 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
GPR55Q9Y2T6 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
GPR55Q9Y2T6 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GPR55Q9Y2T6 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GPR55Q9Y2T6 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GPR55Q9Y2T6 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GPR55Q9Y2T6 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GPR55Q9Y2T6 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GPR55Q9Y2T6 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GPR55Q9Y2T6 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GPR55Q9Y2T6 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GPR55Q9Y2T6 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GPR55Q9Y2T6 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GPR55Q9Y2T6 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GPR55Q9Y2T6 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GPR55Q9Y2T6 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GPR55Q9Y2T6 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GPR55Q9Y2T6 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GPR55Q9Y2T6 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GPR55Q9Y2T6 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GPR55Q9Y2T6 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GPR55Q9Y2T6 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms