Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y244

POMP, Proteasome maturation protein, humanhuman

Predictions only

Length 141 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POMPQ9Y244 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
POMPQ9Y244 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
POMPQ9Y244 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
POMPQ9Y244 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
POMPQ9Y244 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
POMPQ9Y244 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
POMPQ9Y244 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
POMPQ9Y244 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
POMPQ9Y244 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
POMPQ9Y244 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
POMPQ9Y244 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
POMPQ9Y244 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
POMPQ9Y244 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
POMPQ9Y244 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
POMPQ9Y244 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
POMPQ9Y244 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
POMPQ9Y244 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
POMPQ9Y244 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
POMPQ9Y244 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
POMPQ9Y244 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
POMPQ9Y244 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
POMPQ9Y244 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
POMPQ9Y244 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
POMPQ9Y244 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
POMPQ9Y244 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
POMPQ9Y244 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
POMPQ9Y244 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
POMPQ9Y244 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
POMPQ9Y244 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
POMPQ9Y244 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
POMPQ9Y244 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
POMPQ9Y244 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
POMPQ9Y244 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
POMPQ9Y244 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
POMPQ9Y244 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
POMPQ9Y244 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
POMPQ9Y244 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
POMPQ9Y244 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
POMPQ9Y244 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
POMPQ9Y244 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
POMPQ9Y244 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
POMPQ9Y244 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
POMPQ9Y244 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
POMPQ9Y244 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
POMPQ9Y244 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
POMPQ9Y244 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
POMPQ9Y244 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
POMPQ9Y244 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
POMPQ9Y244 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
POMPQ9Y244 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
POMPQ9Y244 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
POMPQ9Y244 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
POMPQ9Y244 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
POMPQ9Y244 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
POMPQ9Y244 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
POMPQ9Y244 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
POMPQ9Y244 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
POMPQ9Y244 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
POMPQ9Y244 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
POMPQ9Y244 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
POMPQ9Y244 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
POMPQ9Y244 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
POMPQ9Y244 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
POMPQ9Y244 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
POMPQ9Y244 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
POMPQ9Y244 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
POMPQ9Y244 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
POMPQ9Y244 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
POMPQ9Y244 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
POMPQ9Y244 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
POMPQ9Y244 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
POMPQ9Y244 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
POMPQ9Y244 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
POMPQ9Y244 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
POMPQ9Y244 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
POMPQ9Y244 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
POMPQ9Y244 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
POMPQ9Y244 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
POMPQ9Y244 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
POMPQ9Y244 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
POMPQ9Y244 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
POMPQ9Y244 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
POMPQ9Y244 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
POMPQ9Y244 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
POMPQ9Y244 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
POMPQ9Y244 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
POMPQ9Y244 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
POMPQ9Y244 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
POMPQ9Y244 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
POMPQ9Y244 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
POMPQ9Y244 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
POMPQ9Y244 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
POMPQ9Y244 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
POMPQ9Y244 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
POMPQ9Y244 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
POMPQ9Y244 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
POMPQ9Y244 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
POMPQ9Y244 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
POMPQ9Y244 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
POMPQ9Y244 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms