Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNG2

TNFSF18, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 18, humanhuman

Predictions only

Length 199 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF18Q9UNG2 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TNFSF18Q9UNG2 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TNFSF18Q9UNG2 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TNFSF18Q9UNG2 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TNFSF18Q9UNG2 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TNFSF18Q9UNG2 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TNFSF18Q9UNG2 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
TNFSF18Q9UNG2 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TNFSF18Q9UNG2 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TNFSF18Q9UNG2 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TNFSF18Q9UNG2 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TNFSF18Q9UNG2 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TNFSF18Q9UNG2 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
TNFSF18Q9UNG2 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TNFSF18Q9UNG2 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TNFSF18Q9UNG2 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TNFSF18Q9UNG2 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TNFSF18Q9UNG2 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TNFSF18Q9UNG2 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TNFSF18Q9UNG2 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TNFSF18Q9UNG2 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TNFSF18Q9UNG2 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TNFSF18Q9UNG2 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TNFSF18Q9UNG2 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
TNFSF18Q9UNG2 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TNFSF18Q9UNG2 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
TNFSF18Q9UNG2 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TNFSF18Q9UNG2 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TNFSF18Q9UNG2 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TNFSF18Q9UNG2 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TNFSF18Q9UNG2 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TNFSF18Q9UNG2 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TNFSF18Q9UNG2 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TNFSF18Q9UNG2 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TNFSF18Q9UNG2 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TNFSF18Q9UNG2 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TNFSF18Q9UNG2 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TNFSF18Q9UNG2 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TNFSF18Q9UNG2 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
TNFSF18Q9UNG2 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TNFSF18Q9UNG2 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TNFSF18Q9UNG2 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TNFSF18Q9UNG2 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TNFSF18Q9UNG2 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TNFSF18Q9UNG2 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TNFSF18Q9UNG2 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TNFSF18Q9UNG2 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TNFSF18Q9UNG2 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TNFSF18Q9UNG2 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TNFSF18Q9UNG2 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TNFSF18Q9UNG2 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TNFSF18Q9UNG2 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TNFSF18Q9UNG2 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
TNFSF18Q9UNG2 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TNFSF18Q9UNG2 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TNFSF18Q9UNG2 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TNFSF18Q9UNG2 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TNFSF18Q9UNG2 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TNFSF18Q9UNG2 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TNFSF18Q9UNG2 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TNFSF18Q9UNG2 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TNFSF18Q9UNG2 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TNFSF18Q9UNG2 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TNFSF18Q9UNG2 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TNFSF18Q9UNG2 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TNFSF18Q9UNG2 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TNFSF18Q9UNG2 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TNFSF18Q9UNG2 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TNFSF18Q9UNG2 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
TNFSF18Q9UNG2 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
TNFSF18Q9UNG2 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TNFSF18Q9UNG2 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TNFSF18Q9UNG2 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TNFSF18Q9UNG2 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TNFSF18Q9UNG2 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TNFSF18Q9UNG2 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TNFSF18Q9UNG2 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TNFSF18Q9UNG2 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TNFSF18Q9UNG2 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TNFSF18Q9UNG2 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TNFSF18Q9UNG2 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TNFSF18Q9UNG2 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TNFSF18Q9UNG2 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TNFSF18Q9UNG2 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TNFSF18Q9UNG2 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TNFSF18Q9UNG2 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TNFSF18Q9UNG2 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TNFSF18Q9UNG2 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TNFSF18Q9UNG2 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TNFSF18Q9UNG2 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TNFSF18Q9UNG2 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TNFSF18Q9UNG2 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TNFSF18Q9UNG2 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TNFSF18Q9UNG2 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TNFSF18Q9UNG2 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TNFSF18Q9UNG2 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TNFSF18Q9UNG2 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TNFSF18Q9UNG2 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TNFSF18Q9UNG2 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TNFSF18Q9UNG2 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms