Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMS6

SYNPO2, Synaptopodin-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,093 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNPO2Q9UMS6 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
SYNPO2Q9UMS6 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
SYNPO2Q9UMS6 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SYNPO2Q9UMS6 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SYNPO2Q9UMS6 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SYNPO2Q9UMS6 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SYNPO2Q9UMS6 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SYNPO2Q9UMS6 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SYNPO2Q9UMS6 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SYNPO2Q9UMS6 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SYNPO2Q9UMS6 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SYNPO2Q9UMS6 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SYNPO2Q9UMS6 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SYNPO2Q9UMS6 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SYNPO2Q9UMS6 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SYNPO2Q9UMS6 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SYNPO2Q9UMS6 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SYNPO2Q9UMS6 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SYNPO2Q9UMS6 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SYNPO2Q9UMS6 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SYNPO2Q9UMS6 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SYNPO2Q9UMS6 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SYNPO2Q9UMS6 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SYNPO2Q9UMS6 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SYNPO2Q9UMS6 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SYNPO2Q9UMS6 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SYNPO2Q9UMS6 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SYNPO2Q9UMS6 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SYNPO2Q9UMS6 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SYNPO2Q9UMS6 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
SYNPO2Q9UMS6 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SYNPO2Q9UMS6 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SYNPO2Q9UMS6 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SYNPO2Q9UMS6 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SYNPO2Q9UMS6 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SYNPO2Q9UMS6 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SYNPO2Q9UMS6 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SYNPO2Q9UMS6 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SYNPO2Q9UMS6 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SYNPO2Q9UMS6 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SYNPO2Q9UMS6 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
SYNPO2Q9UMS6 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SYNPO2Q9UMS6 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SYNPO2Q9UMS6 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SYNPO2Q9UMS6 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SYNPO2Q9UMS6 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
SYNPO2Q9UMS6 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SYNPO2Q9UMS6 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SYNPO2Q9UMS6 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SYNPO2Q9UMS6 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SYNPO2Q9UMS6 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SYNPO2Q9UMS6 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SYNPO2Q9UMS6 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
SYNPO2Q9UMS6 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SYNPO2Q9UMS6 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SYNPO2Q9UMS6 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SYNPO2Q9UMS6 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SYNPO2Q9UMS6 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SYNPO2Q9UMS6 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SYNPO2Q9UMS6 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SYNPO2Q9UMS6 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SYNPO2Q9UMS6 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SYNPO2Q9UMS6 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SYNPO2Q9UMS6 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SYNPO2Q9UMS6 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SYNPO2Q9UMS6 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SYNPO2Q9UMS6 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SYNPO2Q9UMS6 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SYNPO2Q9UMS6 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SYNPO2Q9UMS6 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SYNPO2Q9UMS6 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SYNPO2Q9UMS6 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SYNPO2Q9UMS6 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SYNPO2Q9UMS6 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SYNPO2Q9UMS6 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SYNPO2Q9UMS6 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SYNPO2Q9UMS6 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SYNPO2Q9UMS6 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SYNPO2Q9UMS6 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SYNPO2Q9UMS6 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SYNPO2Q9UMS6 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SYNPO2Q9UMS6 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SYNPO2Q9UMS6 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SYNPO2Q9UMS6 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SYNPO2Q9UMS6 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SYNPO2Q9UMS6 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SYNPO2Q9UMS6 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SYNPO2Q9UMS6 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SYNPO2Q9UMS6 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SYNPO2Q9UMS6 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SYNPO2Q9UMS6 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SYNPO2Q9UMS6 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SYNPO2Q9UMS6 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SYNPO2Q9UMS6 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SYNPO2Q9UMS6 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SYNPO2Q9UMS6 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
SYNPO2Q9UMS6 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SYNPO2Q9UMS6 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SYNPO2Q9UMS6 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SYNPO2Q9UMS6 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms