Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULB1

NRXN1, Neurexin-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRXN1Q9ULB1 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
NRXN1Q9ULB1 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
NRXN1Q9ULB1 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
NRXN1Q9ULB1 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
NRXN1Q9ULB1 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
NRXN1Q9ULB1 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
NRXN1Q9ULB1 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
NRXN1Q9ULB1 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
NRXN1Q9ULB1 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
NRXN1Q9ULB1 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
NRXN1Q9ULB1 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
NRXN1Q9ULB1 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
NRXN1Q9ULB1 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
NRXN1Q9ULB1 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
NRXN1Q9ULB1 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
NRXN1Q9ULB1 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
NRXN1Q9ULB1 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
NRXN1Q9ULB1 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
NRXN1Q9ULB1 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
NRXN1Q9ULB1 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
NRXN1Q9ULB1 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
NRXN1Q9ULB1 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
NRXN1Q9ULB1 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
NRXN1Q9ULB1 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
NRXN1Q9ULB1 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
NRXN1Q9ULB1 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
NRXN1Q9ULB1 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
NRXN1Q9ULB1 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
NRXN1Q9ULB1 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
NRXN1Q9ULB1 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
NRXN1Q9ULB1 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
NRXN1Q9ULB1 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
NRXN1Q9ULB1 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
NRXN1Q9ULB1 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
NRXN1Q9ULB1 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
NRXN1Q9ULB1 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
NRXN1Q9ULB1 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
NRXN1Q9ULB1 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
NRXN1Q9ULB1 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
NRXN1Q9ULB1 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
NRXN1Q9ULB1 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
NRXN1Q9ULB1 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
NRXN1Q9ULB1 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
NRXN1Q9ULB1 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
NRXN1Q9ULB1 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
NRXN1Q9ULB1 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
NRXN1Q9ULB1 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
NRXN1Q9ULB1 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
NRXN1Q9ULB1 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
NRXN1Q9ULB1 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
NRXN1Q9ULB1 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
NRXN1Q9ULB1 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
NRXN1Q9ULB1 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
NRXN1Q9ULB1 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
NRXN1Q9ULB1 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
NRXN1Q9ULB1 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
NRXN1Q9ULB1 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
NRXN1Q9ULB1 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
NRXN1Q9ULB1 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
NRXN1Q9ULB1 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
NRXN1Q9ULB1 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
NRXN1Q9ULB1 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
NRXN1Q9ULB1 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
NRXN1Q9ULB1 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
NRXN1Q9ULB1 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
NRXN1Q9ULB1 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
NRXN1Q9ULB1 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
NRXN1Q9ULB1 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
NRXN1Q9ULB1 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
NRXN1Q9ULB1 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
NRXN1Q9ULB1 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
NRXN1Q9ULB1 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
NRXN1Q9ULB1 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
NRXN1Q9ULB1 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
NRXN1Q9ULB1 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
NRXN1Q9ULB1 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
NRXN1Q9ULB1 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
NRXN1Q9ULB1 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
NRXN1Q9ULB1 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
NRXN1Q9ULB1 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
NRXN1Q9ULB1 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NRXN1Q9ULB1 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NRXN1Q9ULB1 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NRXN1Q9ULB1 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NRXN1Q9ULB1 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
NRXN1Q9ULB1 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NRXN1Q9ULB1 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
NRXN1Q9ULB1 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
NRXN1Q9ULB1 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
NRXN1Q9ULB1 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
NRXN1Q9ULB1 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NRXN1Q9ULB1 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
NRXN1Q9ULB1 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
NRXN1Q9ULB1 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NRXN1Q9ULB1 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NRXN1Q9ULB1 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
NRXN1Q9ULB1 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NRXN1Q9ULB1 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
NRXN1Q9ULB1 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
NRXN1Q9ULB1 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.4 ms