Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKT5

FBXO4, F-box only protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO4Q9UKT5 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
FBXO4Q9UKT5 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
FBXO4Q9UKT5 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
FBXO4Q9UKT5 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
FBXO4Q9UKT5 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
FBXO4Q9UKT5 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
FBXO4Q9UKT5 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
FBXO4Q9UKT5 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
FBXO4Q9UKT5 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
FBXO4Q9UKT5 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
FBXO4Q9UKT5 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
FBXO4Q9UKT5 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
FBXO4Q9UKT5 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
FBXO4Q9UKT5 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
FBXO4Q9UKT5 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
FBXO4Q9UKT5 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
FBXO4Q9UKT5 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
FBXO4Q9UKT5 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
FBXO4Q9UKT5 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
FBXO4Q9UKT5 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
FBXO4Q9UKT5 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
FBXO4Q9UKT5 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
FBXO4Q9UKT5 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
FBXO4Q9UKT5 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
FBXO4Q9UKT5 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
FBXO4Q9UKT5 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
FBXO4Q9UKT5 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
FBXO4Q9UKT5 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
FBXO4Q9UKT5 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
FBXO4Q9UKT5 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
FBXO4Q9UKT5 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
FBXO4Q9UKT5 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
FBXO4Q9UKT5 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
FBXO4Q9UKT5 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
FBXO4Q9UKT5 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
FBXO4Q9UKT5 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
FBXO4Q9UKT5 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
FBXO4Q9UKT5 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
FBXO4Q9UKT5 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
FBXO4Q9UKT5 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
FBXO4Q9UKT5 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
FBXO4Q9UKT5 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
FBXO4Q9UKT5 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
FBXO4Q9UKT5 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
FBXO4Q9UKT5 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
FBXO4Q9UKT5 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
FBXO4Q9UKT5 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
FBXO4Q9UKT5 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
FBXO4Q9UKT5 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
FBXO4Q9UKT5 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
FBXO4Q9UKT5 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
FBXO4Q9UKT5 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
FBXO4Q9UKT5 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
FBXO4Q9UKT5 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
FBXO4Q9UKT5 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
FBXO4Q9UKT5 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
FBXO4Q9UKT5 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
FBXO4Q9UKT5 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
FBXO4Q9UKT5 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
FBXO4Q9UKT5 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
FBXO4Q9UKT5 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
FBXO4Q9UKT5 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
FBXO4Q9UKT5 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
FBXO4Q9UKT5 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
FBXO4Q9UKT5 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
FBXO4Q9UKT5 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
FBXO4Q9UKT5 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
FBXO4Q9UKT5 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
FBXO4Q9UKT5 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
FBXO4Q9UKT5 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
FBXO4Q9UKT5 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
FBXO4Q9UKT5 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
FBXO4Q9UKT5 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
FBXO4Q9UKT5 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
FBXO4Q9UKT5 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
FBXO4Q9UKT5 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
FBXO4Q9UKT5 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
FBXO4Q9UKT5 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
FBXO4Q9UKT5 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
FBXO4Q9UKT5 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
FBXO4Q9UKT5 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
FBXO4Q9UKT5 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
FBXO4Q9UKT5 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
FBXO4Q9UKT5 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
FBXO4Q9UKT5 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
FBXO4Q9UKT5 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
FBXO4Q9UKT5 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
FBXO4Q9UKT5 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
FBXO4Q9UKT5 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
FBXO4Q9UKT5 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
FBXO4Q9UKT5 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
FBXO4Q9UKT5 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
FBXO4Q9UKT5 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
FBXO4Q9UKT5 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
FBXO4Q9UKT5 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
FBXO4Q9UKT5 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
FBXO4Q9UKT5 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
FBXO4Q9UKT5 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
FBXO4Q9UKT5 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
FBXO4Q9UKT5 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms