Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJT0

TUBE1, Tubulin epsilon chain, humanhuman

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBE1Q9UJT0 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
TUBE1Q9UJT0 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TUBE1Q9UJT0 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TUBE1Q9UJT0 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TUBE1Q9UJT0 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TUBE1Q9UJT0 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TUBE1Q9UJT0 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TUBE1Q9UJT0 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TUBE1Q9UJT0 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TUBE1Q9UJT0 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TUBE1Q9UJT0 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TUBE1Q9UJT0 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
TUBE1Q9UJT0 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TUBE1Q9UJT0 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TUBE1Q9UJT0 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TUBE1Q9UJT0 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TUBE1Q9UJT0 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TUBE1Q9UJT0 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
TUBE1Q9UJT0 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
TUBE1Q9UJT0 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
TUBE1Q9UJT0 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TUBE1Q9UJT0 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TUBE1Q9UJT0 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TUBE1Q9UJT0 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TUBE1Q9UJT0 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TUBE1Q9UJT0 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TUBE1Q9UJT0 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TUBE1Q9UJT0 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TUBE1Q9UJT0 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TUBE1Q9UJT0 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TUBE1Q9UJT0 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TUBE1Q9UJT0 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TUBE1Q9UJT0 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TUBE1Q9UJT0 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TUBE1Q9UJT0 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TUBE1Q9UJT0 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TUBE1Q9UJT0 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TUBE1Q9UJT0 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TUBE1Q9UJT0 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TUBE1Q9UJT0 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TUBE1Q9UJT0 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TUBE1Q9UJT0 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TUBE1Q9UJT0 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TUBE1Q9UJT0 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TUBE1Q9UJT0 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TUBE1Q9UJT0 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TUBE1Q9UJT0 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TUBE1Q9UJT0 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TUBE1Q9UJT0 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TUBE1Q9UJT0 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TUBE1Q9UJT0 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TUBE1Q9UJT0 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TUBE1Q9UJT0 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TUBE1Q9UJT0 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TUBE1Q9UJT0 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TUBE1Q9UJT0 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TUBE1Q9UJT0 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TUBE1Q9UJT0 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TUBE1Q9UJT0 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TUBE1Q9UJT0 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TUBE1Q9UJT0 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TUBE1Q9UJT0 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TUBE1Q9UJT0 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TUBE1Q9UJT0 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TUBE1Q9UJT0 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TUBE1Q9UJT0 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TUBE1Q9UJT0 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TUBE1Q9UJT0 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TUBE1Q9UJT0 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TUBE1Q9UJT0 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
TUBE1Q9UJT0 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TUBE1Q9UJT0 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TUBE1Q9UJT0 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TUBE1Q9UJT0 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TUBE1Q9UJT0 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TUBE1Q9UJT0 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TUBE1Q9UJT0 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
TUBE1Q9UJT0 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
TUBE1Q9UJT0 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TUBE1Q9UJT0 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TUBE1Q9UJT0 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TUBE1Q9UJT0 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
TUBE1Q9UJT0 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TUBE1Q9UJT0 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TUBE1Q9UJT0 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TUBE1Q9UJT0 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TUBE1Q9UJT0 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TUBE1Q9UJT0 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TUBE1Q9UJT0 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TUBE1Q9UJT0 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TUBE1Q9UJT0 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TUBE1Q9UJT0 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TUBE1Q9UJT0 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TUBE1Q9UJT0 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TUBE1Q9UJT0 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TUBE1Q9UJT0 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TUBE1Q9UJT0 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TUBE1Q9UJT0 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TUBE1Q9UJT0 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TUBE1Q9UJT0 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.4 ms