Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHJ9

PGAP2, Post-GPI attachment to proteins factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGAP2Q9UHJ9 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
PGAP2Q9UHJ9 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
PGAP2Q9UHJ9 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PGAP2Q9UHJ9 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PGAP2Q9UHJ9 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PGAP2Q9UHJ9 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PGAP2Q9UHJ9 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PGAP2Q9UHJ9 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PGAP2Q9UHJ9 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PGAP2Q9UHJ9 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PGAP2Q9UHJ9 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PGAP2Q9UHJ9 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PGAP2Q9UHJ9 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PGAP2Q9UHJ9 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PGAP2Q9UHJ9 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PGAP2Q9UHJ9 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PGAP2Q9UHJ9 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PGAP2Q9UHJ9 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PGAP2Q9UHJ9 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PGAP2Q9UHJ9 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PGAP2Q9UHJ9 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PGAP2Q9UHJ9 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PGAP2Q9UHJ9 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PGAP2Q9UHJ9 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PGAP2Q9UHJ9 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PGAP2Q9UHJ9 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PGAP2Q9UHJ9 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PGAP2Q9UHJ9 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PGAP2Q9UHJ9 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PGAP2Q9UHJ9 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PGAP2Q9UHJ9 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PGAP2Q9UHJ9 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PGAP2Q9UHJ9 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PGAP2Q9UHJ9 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PGAP2Q9UHJ9 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
PGAP2Q9UHJ9 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PGAP2Q9UHJ9 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PGAP2Q9UHJ9 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
PGAP2Q9UHJ9 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PGAP2Q9UHJ9 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PGAP2Q9UHJ9 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PGAP2Q9UHJ9 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PGAP2Q9UHJ9 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
PGAP2Q9UHJ9 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PGAP2Q9UHJ9 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PGAP2Q9UHJ9 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
PGAP2Q9UHJ9 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PGAP2Q9UHJ9 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PGAP2Q9UHJ9 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PGAP2Q9UHJ9 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PGAP2Q9UHJ9 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PGAP2Q9UHJ9 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PGAP2Q9UHJ9 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PGAP2Q9UHJ9 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
PGAP2Q9UHJ9 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
PGAP2Q9UHJ9 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PGAP2Q9UHJ9 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PGAP2Q9UHJ9 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PGAP2Q9UHJ9 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PGAP2Q9UHJ9 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PGAP2Q9UHJ9 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PGAP2Q9UHJ9 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PGAP2Q9UHJ9 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PGAP2Q9UHJ9 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PGAP2Q9UHJ9 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PGAP2Q9UHJ9 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PGAP2Q9UHJ9 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PGAP2Q9UHJ9 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PGAP2Q9UHJ9 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PGAP2Q9UHJ9 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
PGAP2Q9UHJ9 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PGAP2Q9UHJ9 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PGAP2Q9UHJ9 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
PGAP2Q9UHJ9 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PGAP2Q9UHJ9 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PGAP2Q9UHJ9 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PGAP2Q9UHJ9 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PGAP2Q9UHJ9 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
PGAP2Q9UHJ9 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PGAP2Q9UHJ9 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PGAP2Q9UHJ9 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PGAP2Q9UHJ9 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PGAP2Q9UHJ9 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PGAP2Q9UHJ9 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PGAP2Q9UHJ9 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PGAP2Q9UHJ9 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PGAP2Q9UHJ9 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PGAP2Q9UHJ9 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PGAP2Q9UHJ9 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
PGAP2Q9UHJ9 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PGAP2Q9UHJ9 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PGAP2Q9UHJ9 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PGAP2Q9UHJ9 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PGAP2Q9UHJ9 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PGAP2Q9UHJ9 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
PGAP2Q9UHJ9 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC22■■□□□ 1.11
PGAP2Q9UHJ9 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
PGAP2Q9UHJ9 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PGAP2Q9UHJ9 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PGAP2Q9UHJ9 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms