Protein–RNA interactions for Protein: Q9UDT6

CLIP2, CAP-Gly domain-containing linker protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,046 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP2Q9UDT6 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CLIP2Q9UDT6 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CLIP2Q9UDT6 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CLIP2Q9UDT6 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CLIP2Q9UDT6 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CLIP2Q9UDT6 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CLIP2Q9UDT6 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CLIP2Q9UDT6 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CLIP2Q9UDT6 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CLIP2Q9UDT6 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CLIP2Q9UDT6 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CLIP2Q9UDT6 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CLIP2Q9UDT6 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CLIP2Q9UDT6 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CLIP2Q9UDT6 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CLIP2Q9UDT6 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CLIP2Q9UDT6 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CLIP2Q9UDT6 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CLIP2Q9UDT6 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CLIP2Q9UDT6 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CLIP2Q9UDT6 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CLIP2Q9UDT6 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CLIP2Q9UDT6 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CLIP2Q9UDT6 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CLIP2Q9UDT6 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CLIP2Q9UDT6 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CLIP2Q9UDT6 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CLIP2Q9UDT6 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CLIP2Q9UDT6 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CLIP2Q9UDT6 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CLIP2Q9UDT6 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CLIP2Q9UDT6 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CLIP2Q9UDT6 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CLIP2Q9UDT6 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CLIP2Q9UDT6 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CLIP2Q9UDT6 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CLIP2Q9UDT6 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CLIP2Q9UDT6 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CLIP2Q9UDT6 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CLIP2Q9UDT6 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CLIP2Q9UDT6 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CLIP2Q9UDT6 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CLIP2Q9UDT6 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CLIP2Q9UDT6 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CLIP2Q9UDT6 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CLIP2Q9UDT6 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CLIP2Q9UDT6 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CLIP2Q9UDT6 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CLIP2Q9UDT6 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CLIP2Q9UDT6 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CLIP2Q9UDT6 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CLIP2Q9UDT6 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CLIP2Q9UDT6 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CLIP2Q9UDT6 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CLIP2Q9UDT6 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CLIP2Q9UDT6 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CLIP2Q9UDT6 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CLIP2Q9UDT6 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CLIP2Q9UDT6 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CLIP2Q9UDT6 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CLIP2Q9UDT6 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CLIP2Q9UDT6 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CLIP2Q9UDT6 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CLIP2Q9UDT6 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CLIP2Q9UDT6 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CLIP2Q9UDT6 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CLIP2Q9UDT6 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CLIP2Q9UDT6 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CLIP2Q9UDT6 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CLIP2Q9UDT6 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CLIP2Q9UDT6 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CLIP2Q9UDT6 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CLIP2Q9UDT6 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CLIP2Q9UDT6 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CLIP2Q9UDT6 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CLIP2Q9UDT6 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CLIP2Q9UDT6 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CLIP2Q9UDT6 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CLIP2Q9UDT6 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CLIP2Q9UDT6 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CLIP2Q9UDT6 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CLIP2Q9UDT6 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CLIP2Q9UDT6 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CLIP2Q9UDT6 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CLIP2Q9UDT6 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CLIP2Q9UDT6 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CLIP2Q9UDT6 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CLIP2Q9UDT6 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CLIP2Q9UDT6 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CLIP2Q9UDT6 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CLIP2Q9UDT6 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CLIP2Q9UDT6 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CLIP2Q9UDT6 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CLIP2Q9UDT6 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CLIP2Q9UDT6 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CLIP2Q9UDT6 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CLIP2Q9UDT6 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CLIP2Q9UDT6 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CLIP2Q9UDT6 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CLIP2Q9UDT6 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms