Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBF2

COPG2, Coatomer subunit gamma-2, humanhuman

Predictions only

Length 871 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPG2Q9UBF2 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
COPG2Q9UBF2 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
COPG2Q9UBF2 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
COPG2Q9UBF2 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC18.55■□□□□ 0.56
COPG2Q9UBF2 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
COPG2Q9UBF2 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
COPG2Q9UBF2 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC18.55■□□□□ 0.56
COPG2Q9UBF2 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
COPG2Q9UBF2 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
COPG2Q9UBF2 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
COPG2Q9UBF2 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
COPG2Q9UBF2 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
COPG2Q9UBF2 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
COPG2Q9UBF2 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
COPG2Q9UBF2 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
COPG2Q9UBF2 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
COPG2Q9UBF2 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
COPG2Q9UBF2 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
COPG2Q9UBF2 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
COPG2Q9UBF2 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
COPG2Q9UBF2 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
COPG2Q9UBF2 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
COPG2Q9UBF2 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
COPG2Q9UBF2 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
COPG2Q9UBF2 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
COPG2Q9UBF2 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
COPG2Q9UBF2 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
COPG2Q9UBF2 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
COPG2Q9UBF2 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
COPG2Q9UBF2 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
COPG2Q9UBF2 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
COPG2Q9UBF2 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
COPG2Q9UBF2 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
COPG2Q9UBF2 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
COPG2Q9UBF2 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
COPG2Q9UBF2 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
COPG2Q9UBF2 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
COPG2Q9UBF2 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
COPG2Q9UBF2 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
COPG2Q9UBF2 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
COPG2Q9UBF2 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
COPG2Q9UBF2 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
COPG2Q9UBF2 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
COPG2Q9UBF2 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
COPG2Q9UBF2 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
COPG2Q9UBF2 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
COPG2Q9UBF2 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
COPG2Q9UBF2 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
COPG2Q9UBF2 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
COPG2Q9UBF2 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
COPG2Q9UBF2 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
COPG2Q9UBF2 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
COPG2Q9UBF2 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
COPG2Q9UBF2 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
COPG2Q9UBF2 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
COPG2Q9UBF2 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
COPG2Q9UBF2 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
COPG2Q9UBF2 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
COPG2Q9UBF2 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
COPG2Q9UBF2 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
COPG2Q9UBF2 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
COPG2Q9UBF2 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
COPG2Q9UBF2 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
COPG2Q9UBF2 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
COPG2Q9UBF2 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
COPG2Q9UBF2 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
COPG2Q9UBF2 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
COPG2Q9UBF2 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
COPG2Q9UBF2 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
COPG2Q9UBF2 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
COPG2Q9UBF2 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
COPG2Q9UBF2 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
COPG2Q9UBF2 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
COPG2Q9UBF2 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
COPG2Q9UBF2 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
COPG2Q9UBF2 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
COPG2Q9UBF2 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
COPG2Q9UBF2 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
COPG2Q9UBF2 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
COPG2Q9UBF2 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
COPG2Q9UBF2 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
COPG2Q9UBF2 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
COPG2Q9UBF2 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
COPG2Q9UBF2 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
COPG2Q9UBF2 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
COPG2Q9UBF2 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
COPG2Q9UBF2 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
COPG2Q9UBF2 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
COPG2Q9UBF2 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
COPG2Q9UBF2 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
COPG2Q9UBF2 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
COPG2Q9UBF2 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
COPG2Q9UBF2 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
COPG2Q9UBF2 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
COPG2Q9UBF2 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
COPG2Q9UBF2 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
COPG2Q9UBF2 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
COPG2Q9UBF2 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
COPG2Q9UBF2 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
COPG2Q9UBF2 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms