Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z9

CCDC180, Coiled-coil domain-containing protein 180, humanhuman

Predictions only

Length 1,646 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC180Q9P1Z9 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.94■■■■□ 3.66
CCDC180Q9P1Z9 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.93■■■■□ 3.66
CCDC180Q9P1Z9 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC37.93■■■■□ 3.66
CCDC180Q9P1Z9 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.93■■■■□ 3.66
CCDC180Q9P1Z9 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC37.93■■■■□ 3.66
CCDC180Q9P1Z9 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.93■■■■□ 3.66
CCDC180Q9P1Z9 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC37.93■■■■□ 3.66
CCDC180Q9P1Z9 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.93■■■■□ 3.66
CCDC180Q9P1Z9 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC37.93■■■■□ 3.66
CCDC180Q9P1Z9 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC37.93■■■■□ 3.66
CCDC180Q9P1Z9 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC37.93■■■■□ 3.66
CCDC180Q9P1Z9 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC37.93■■■■□ 3.66
CCDC180Q9P1Z9 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.93■■■■□ 3.66
CCDC180Q9P1Z9 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.93■■■■□ 3.66
CCDC180Q9P1Z9 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.92■■■■□ 3.66
CCDC180Q9P1Z9 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC37.92■■■■□ 3.66
CCDC180Q9P1Z9 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC37.92■■■■□ 3.66
CCDC180Q9P1Z9 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC37.92■■■■□ 3.66
CCDC180Q9P1Z9 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.91■■■■□ 3.66
CCDC180Q9P1Z9 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC37.91■■■■□ 3.66
CCDC180Q9P1Z9 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.91■■■■□ 3.66
CCDC180Q9P1Z9 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.91■■■■□ 3.66
CCDC180Q9P1Z9 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.91■■■■□ 3.66
CCDC180Q9P1Z9 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC37.91■■■■□ 3.66
CCDC180Q9P1Z9 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC37.91■■■■□ 3.66
CCDC180Q9P1Z9 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC37.91■■■■□ 3.66
CCDC180Q9P1Z9 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC37.91■■■■□ 3.66
CCDC180Q9P1Z9 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC37.91■■■■□ 3.66
CCDC180Q9P1Z9 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC37.91■■■■□ 3.66
CCDC180Q9P1Z9 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.91■■■■□ 3.66
CCDC180Q9P1Z9 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.91■■■■□ 3.66
CCDC180Q9P1Z9 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.91■■■■□ 3.66
CCDC180Q9P1Z9 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC37.91■■■■□ 3.66
CCDC180Q9P1Z9 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC37.91■■■■□ 3.66
CCDC180Q9P1Z9 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC37.91■■■■□ 3.66
CCDC180Q9P1Z9 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.91■■■■□ 3.66
CCDC180Q9P1Z9 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC37.9■■■■□ 3.66
CCDC180Q9P1Z9 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC37.9■■■■□ 3.66
CCDC180Q9P1Z9 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC37.9■■■■□ 3.66
CCDC180Q9P1Z9 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC37.9■■■■□ 3.66
CCDC180Q9P1Z9 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC37.9■■■■□ 3.66
CCDC180Q9P1Z9 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC37.9■■■■□ 3.66
CCDC180Q9P1Z9 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC37.9■■■■□ 3.66
CCDC180Q9P1Z9 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.9■■■■□ 3.66
CCDC180Q9P1Z9 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.9■■■■□ 3.66
CCDC180Q9P1Z9 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC37.9■■■■□ 3.66
CCDC180Q9P1Z9 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC37.9■■■■□ 3.66
CCDC180Q9P1Z9 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.9■■■■□ 3.66
CCDC180Q9P1Z9 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC37.9■■■■□ 3.66
CCDC180Q9P1Z9 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC37.9■■■■□ 3.66
CCDC180Q9P1Z9 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC37.9■■■■□ 3.66
CCDC180Q9P1Z9 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.9■■■■□ 3.66
CCDC180Q9P1Z9 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC37.9■■■■□ 3.66
CCDC180Q9P1Z9 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC37.9■■■■□ 3.66
CCDC180Q9P1Z9 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC37.89■■■■□ 3.66
CCDC180Q9P1Z9 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.89■■■■□ 3.66
CCDC180Q9P1Z9 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC37.89■■■■□ 3.66
CCDC180Q9P1Z9 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC37.89■■■■□ 3.66
CCDC180Q9P1Z9 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC37.89■■■■□ 3.66
CCDC180Q9P1Z9 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC37.89■■■■□ 3.66
CCDC180Q9P1Z9 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC37.88■■■■□ 3.66
CCDC180Q9P1Z9 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC37.88■■■■□ 3.66
CCDC180Q9P1Z9 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.88■■■■□ 3.65
CCDC180Q9P1Z9 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.88■■■■□ 3.65
CCDC180Q9P1Z9 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.88■■■■□ 3.65
CCDC180Q9P1Z9 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC37.88■■■■□ 3.65
CCDC180Q9P1Z9 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC37.88■■■■□ 3.65
CCDC180Q9P1Z9 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC37.88■■■■□ 3.65
CCDC180Q9P1Z9 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC37.88■■■■□ 3.65
CCDC180Q9P1Z9 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC37.88■■■■□ 3.65
CCDC180Q9P1Z9 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.88■■■■□ 3.65
CCDC180Q9P1Z9 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.88■■■■□ 3.65
CCDC180Q9P1Z9 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.88■■■■□ 3.65
CCDC180Q9P1Z9 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.87■■■■□ 3.65
CCDC180Q9P1Z9 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC37.87■■■■□ 3.65
CCDC180Q9P1Z9 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC37.87■■■■□ 3.65
CCDC180Q9P1Z9 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC37.87■■■■□ 3.65
CCDC180Q9P1Z9 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC37.87■■■■□ 3.65
CCDC180Q9P1Z9 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC37.87■■■■□ 3.65
CCDC180Q9P1Z9 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC37.87■■■■□ 3.65
CCDC180Q9P1Z9 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC37.87■■■■□ 3.65
CCDC180Q9P1Z9 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC37.87■■■■□ 3.65
CCDC180Q9P1Z9 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC37.87■■■■□ 3.65
CCDC180Q9P1Z9 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC37.86■■■■□ 3.65
CCDC180Q9P1Z9 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC37.86■■■■□ 3.65
CCDC180Q9P1Z9 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC37.86■■■■□ 3.65
CCDC180Q9P1Z9 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.86■■■■□ 3.65
CCDC180Q9P1Z9 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC37.86■■■■□ 3.65
CCDC180Q9P1Z9 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC37.86■■■■□ 3.65
CCDC180Q9P1Z9 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC37.86■■■■□ 3.65
CCDC180Q9P1Z9 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC37.86■■■■□ 3.65
CCDC180Q9P1Z9 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.86■■■■□ 3.65
CCDC180Q9P1Z9 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC37.86■■■■□ 3.65
CCDC180Q9P1Z9 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC37.86■■■■□ 3.65
CCDC180Q9P1Z9 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC37.85■■■■□ 3.65
CCDC180Q9P1Z9 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.85■■■■□ 3.65
CCDC180Q9P1Z9 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC37.85■■■■□ 3.65
CCDC180Q9P1Z9 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.85■■■■□ 3.65
CCDC180Q9P1Z9 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.85■■■■□ 3.65
CCDC180Q9P1Z9 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC37.85■■■■□ 3.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms