Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYG2

ZDHHC3, Palmitoyltransferase ZDHHC3, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZDHHC3Q9NYG2 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZDHHC3Q9NYG2 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZDHHC3Q9NYG2 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZDHHC3Q9NYG2 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZDHHC3Q9NYG2 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZDHHC3Q9NYG2 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZDHHC3Q9NYG2 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZDHHC3Q9NYG2 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZDHHC3Q9NYG2 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZDHHC3Q9NYG2 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
ZDHHC3Q9NYG2 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZDHHC3Q9NYG2 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZDHHC3Q9NYG2 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZDHHC3Q9NYG2 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZDHHC3Q9NYG2 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZDHHC3Q9NYG2 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
ZDHHC3Q9NYG2 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZDHHC3Q9NYG2 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZDHHC3Q9NYG2 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZDHHC3Q9NYG2 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZDHHC3Q9NYG2 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZDHHC3Q9NYG2 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZDHHC3Q9NYG2 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZDHHC3Q9NYG2 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZDHHC3Q9NYG2 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZDHHC3Q9NYG2 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZDHHC3Q9NYG2 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZDHHC3Q9NYG2 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ZDHHC3Q9NYG2 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ZDHHC3Q9NYG2 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ZDHHC3Q9NYG2 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ZDHHC3Q9NYG2 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ZDHHC3Q9NYG2 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ZDHHC3Q9NYG2 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ZDHHC3Q9NYG2 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ZDHHC3Q9NYG2 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ZDHHC3Q9NYG2 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ZDHHC3Q9NYG2 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ZDHHC3Q9NYG2 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ZDHHC3Q9NYG2 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ZDHHC3Q9NYG2 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ZDHHC3Q9NYG2 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ZDHHC3Q9NYG2 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ZDHHC3Q9NYG2 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ZDHHC3Q9NYG2 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ZDHHC3Q9NYG2 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ZDHHC3Q9NYG2 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ZDHHC3Q9NYG2 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ZDHHC3Q9NYG2 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ZDHHC3Q9NYG2 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ZDHHC3Q9NYG2 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
ZDHHC3Q9NYG2 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ZDHHC3Q9NYG2 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ZDHHC3Q9NYG2 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ZDHHC3Q9NYG2 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ZDHHC3Q9NYG2 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ZDHHC3Q9NYG2 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ZDHHC3Q9NYG2 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
ZDHHC3Q9NYG2 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ZDHHC3Q9NYG2 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ZDHHC3Q9NYG2 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ZDHHC3Q9NYG2 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ZDHHC3Q9NYG2 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ZDHHC3Q9NYG2 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ZDHHC3Q9NYG2 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ZDHHC3Q9NYG2 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ZDHHC3Q9NYG2 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ZDHHC3Q9NYG2 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ZDHHC3Q9NYG2 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ZDHHC3Q9NYG2 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ZDHHC3Q9NYG2 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ZDHHC3Q9NYG2 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ZDHHC3Q9NYG2 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ZDHHC3Q9NYG2 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ZDHHC3Q9NYG2 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ZDHHC3Q9NYG2 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ZDHHC3Q9NYG2 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ZDHHC3Q9NYG2 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ZDHHC3Q9NYG2 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ZDHHC3Q9NYG2 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ZDHHC3Q9NYG2 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ZDHHC3Q9NYG2 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ZDHHC3Q9NYG2 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ZDHHC3Q9NYG2 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ZDHHC3Q9NYG2 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ZDHHC3Q9NYG2 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ZDHHC3Q9NYG2 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ZDHHC3Q9NYG2 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ZDHHC3Q9NYG2 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ZDHHC3Q9NYG2 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ZDHHC3Q9NYG2 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
ZDHHC3Q9NYG2 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ZDHHC3Q9NYG2 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ZDHHC3Q9NYG2 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ZDHHC3Q9NYG2 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ZDHHC3Q9NYG2 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ZDHHC3Q9NYG2 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ZDHHC3Q9NYG2 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ZDHHC3Q9NYG2 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
ZDHHC3Q9NYG2 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms