Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWB7

IFT57, Intraflagellar transport protein 57 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT57Q9NWB7 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
IFT57Q9NWB7 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
IFT57Q9NWB7 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
IFT57Q9NWB7 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
IFT57Q9NWB7 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
IFT57Q9NWB7 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
IFT57Q9NWB7 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
IFT57Q9NWB7 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
IFT57Q9NWB7 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
IFT57Q9NWB7 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
IFT57Q9NWB7 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
IFT57Q9NWB7 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
IFT57Q9NWB7 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
IFT57Q9NWB7 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
IFT57Q9NWB7 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
IFT57Q9NWB7 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
IFT57Q9NWB7 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
IFT57Q9NWB7 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
IFT57Q9NWB7 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
IFT57Q9NWB7 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
IFT57Q9NWB7 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
IFT57Q9NWB7 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
IFT57Q9NWB7 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
IFT57Q9NWB7 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
IFT57Q9NWB7 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
IFT57Q9NWB7 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
IFT57Q9NWB7 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
IFT57Q9NWB7 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
IFT57Q9NWB7 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
IFT57Q9NWB7 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
IFT57Q9NWB7 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
IFT57Q9NWB7 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
IFT57Q9NWB7 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
IFT57Q9NWB7 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
IFT57Q9NWB7 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
IFT57Q9NWB7 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
IFT57Q9NWB7 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
IFT57Q9NWB7 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
IFT57Q9NWB7 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
IFT57Q9NWB7 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
IFT57Q9NWB7 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
IFT57Q9NWB7 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
IFT57Q9NWB7 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
IFT57Q9NWB7 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
IFT57Q9NWB7 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
IFT57Q9NWB7 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
IFT57Q9NWB7 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
IFT57Q9NWB7 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
IFT57Q9NWB7 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
IFT57Q9NWB7 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC24■■□□□ 1.43
IFT57Q9NWB7 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC24■■□□□ 1.43
IFT57Q9NWB7 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC24■■□□□ 1.43
IFT57Q9NWB7 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
IFT57Q9NWB7 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
IFT57Q9NWB7 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC24■■□□□ 1.43
IFT57Q9NWB7 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
IFT57Q9NWB7 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
IFT57Q9NWB7 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
IFT57Q9NWB7 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
IFT57Q9NWB7 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC24■■□□□ 1.43
IFT57Q9NWB7 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
IFT57Q9NWB7 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
IFT57Q9NWB7 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
IFT57Q9NWB7 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
IFT57Q9NWB7 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
IFT57Q9NWB7 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
IFT57Q9NWB7 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
IFT57Q9NWB7 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
IFT57Q9NWB7 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
IFT57Q9NWB7 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
IFT57Q9NWB7 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
IFT57Q9NWB7 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC23.99■■□□□ 1.43
IFT57Q9NWB7 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
IFT57Q9NWB7 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
IFT57Q9NWB7 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
IFT57Q9NWB7 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
IFT57Q9NWB7 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
IFT57Q9NWB7 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
IFT57Q9NWB7 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
IFT57Q9NWB7 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
IFT57Q9NWB7 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
IFT57Q9NWB7 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
IFT57Q9NWB7 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
IFT57Q9NWB7 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
IFT57Q9NWB7 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
IFT57Q9NWB7 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
IFT57Q9NWB7 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
IFT57Q9NWB7 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
IFT57Q9NWB7 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
IFT57Q9NWB7 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
IFT57Q9NWB7 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
IFT57Q9NWB7 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
IFT57Q9NWB7 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
IFT57Q9NWB7 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
IFT57Q9NWB7 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
IFT57Q9NWB7 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
IFT57Q9NWB7 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
IFT57Q9NWB7 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
IFT57Q9NWB7 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
IFT57Q9NWB7 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 7.9 ms