Protein–RNA interactions for Protein: Q9NW68

BSDC1, BSD domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 430 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BSDC1Q9NW68 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BSDC1Q9NW68 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
BSDC1Q9NW68 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BSDC1Q9NW68 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BSDC1Q9NW68 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
BSDC1Q9NW68 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
BSDC1Q9NW68 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
BSDC1Q9NW68 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
BSDC1Q9NW68 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
BSDC1Q9NW68 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
BSDC1Q9NW68 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
BSDC1Q9NW68 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
BSDC1Q9NW68 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
BSDC1Q9NW68 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BSDC1Q9NW68 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
BSDC1Q9NW68 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
BSDC1Q9NW68 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BSDC1Q9NW68 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BSDC1Q9NW68 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BSDC1Q9NW68 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
BSDC1Q9NW68 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
BSDC1Q9NW68 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
BSDC1Q9NW68 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
BSDC1Q9NW68 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
BSDC1Q9NW68 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BSDC1Q9NW68 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BSDC1Q9NW68 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
BSDC1Q9NW68 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
BSDC1Q9NW68 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
BSDC1Q9NW68 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
BSDC1Q9NW68 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
BSDC1Q9NW68 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
BSDC1Q9NW68 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
BSDC1Q9NW68 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
BSDC1Q9NW68 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
BSDC1Q9NW68 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
BSDC1Q9NW68 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
BSDC1Q9NW68 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
BSDC1Q9NW68 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
BSDC1Q9NW68 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
BSDC1Q9NW68 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
BSDC1Q9NW68 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
BSDC1Q9NW68 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
BSDC1Q9NW68 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
BSDC1Q9NW68 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
BSDC1Q9NW68 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
BSDC1Q9NW68 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
BSDC1Q9NW68 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
BSDC1Q9NW68 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
BSDC1Q9NW68 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
BSDC1Q9NW68 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
BSDC1Q9NW68 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
BSDC1Q9NW68 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
BSDC1Q9NW68 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
BSDC1Q9NW68 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
BSDC1Q9NW68 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
BSDC1Q9NW68 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
BSDC1Q9NW68 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
BSDC1Q9NW68 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
BSDC1Q9NW68 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
BSDC1Q9NW68 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
BSDC1Q9NW68 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
BSDC1Q9NW68 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
BSDC1Q9NW68 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
BSDC1Q9NW68 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
BSDC1Q9NW68 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
BSDC1Q9NW68 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
BSDC1Q9NW68 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
BSDC1Q9NW68 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
BSDC1Q9NW68 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
BSDC1Q9NW68 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
BSDC1Q9NW68 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
BSDC1Q9NW68 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
BSDC1Q9NW68 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
BSDC1Q9NW68 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
BSDC1Q9NW68 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
BSDC1Q9NW68 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
BSDC1Q9NW68 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
BSDC1Q9NW68 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
BSDC1Q9NW68 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
BSDC1Q9NW68 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
BSDC1Q9NW68 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
BSDC1Q9NW68 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
BSDC1Q9NW68 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
BSDC1Q9NW68 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
BSDC1Q9NW68 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
BSDC1Q9NW68 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
BSDC1Q9NW68 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
BSDC1Q9NW68 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
BSDC1Q9NW68 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
BSDC1Q9NW68 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
BSDC1Q9NW68 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
BSDC1Q9NW68 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
BSDC1Q9NW68 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
BSDC1Q9NW68 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
BSDC1Q9NW68 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
BSDC1Q9NW68 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
BSDC1Q9NW68 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
BSDC1Q9NW68 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
BSDC1Q9NW68 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms