Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVF7

FBXO28, F-box only protein 28, humanhuman

Predictions only

Length 368 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO28Q9NVF7 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
FBXO28Q9NVF7 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
FBXO28Q9NVF7 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
FBXO28Q9NVF7 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
FBXO28Q9NVF7 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
FBXO28Q9NVF7 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
FBXO28Q9NVF7 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
FBXO28Q9NVF7 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
FBXO28Q9NVF7 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
FBXO28Q9NVF7 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
FBXO28Q9NVF7 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
FBXO28Q9NVF7 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
FBXO28Q9NVF7 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
FBXO28Q9NVF7 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
FBXO28Q9NVF7 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
FBXO28Q9NVF7 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
FBXO28Q9NVF7 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
FBXO28Q9NVF7 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
FBXO28Q9NVF7 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
FBXO28Q9NVF7 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
FBXO28Q9NVF7 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
FBXO28Q9NVF7 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
FBXO28Q9NVF7 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
FBXO28Q9NVF7 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FBXO28Q9NVF7 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
FBXO28Q9NVF7 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FBXO28Q9NVF7 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FBXO28Q9NVF7 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
FBXO28Q9NVF7 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FBXO28Q9NVF7 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
FBXO28Q9NVF7 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
FBXO28Q9NVF7 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FBXO28Q9NVF7 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FBXO28Q9NVF7 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
FBXO28Q9NVF7 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
FBXO28Q9NVF7 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
FBXO28Q9NVF7 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
FBXO28Q9NVF7 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FBXO28Q9NVF7 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
FBXO28Q9NVF7 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FBXO28Q9NVF7 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FBXO28Q9NVF7 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FBXO28Q9NVF7 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FBXO28Q9NVF7 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
FBXO28Q9NVF7 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
FBXO28Q9NVF7 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
FBXO28Q9NVF7 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FBXO28Q9NVF7 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FBXO28Q9NVF7 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FBXO28Q9NVF7 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
FBXO28Q9NVF7 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FBXO28Q9NVF7 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
FBXO28Q9NVF7 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
FBXO28Q9NVF7 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
FBXO28Q9NVF7 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
FBXO28Q9NVF7 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
FBXO28Q9NVF7 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
FBXO28Q9NVF7 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
FBXO28Q9NVF7 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FBXO28Q9NVF7 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
FBXO28Q9NVF7 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FBXO28Q9NVF7 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
FBXO28Q9NVF7 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
FBXO28Q9NVF7 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
FBXO28Q9NVF7 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FBXO28Q9NVF7 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
FBXO28Q9NVF7 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
FBXO28Q9NVF7 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FBXO28Q9NVF7 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
FBXO28Q9NVF7 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
FBXO28Q9NVF7 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FBXO28Q9NVF7 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FBXO28Q9NVF7 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FBXO28Q9NVF7 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
FBXO28Q9NVF7 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
FBXO28Q9NVF7 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FBXO28Q9NVF7 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
FBXO28Q9NVF7 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
FBXO28Q9NVF7 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FBXO28Q9NVF7 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FBXO28Q9NVF7 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FBXO28Q9NVF7 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FBXO28Q9NVF7 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
FBXO28Q9NVF7 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
FBXO28Q9NVF7 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
FBXO28Q9NVF7 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FBXO28Q9NVF7 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
FBXO28Q9NVF7 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
FBXO28Q9NVF7 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
FBXO28Q9NVF7 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FBXO28Q9NVF7 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FBXO28Q9NVF7 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
FBXO28Q9NVF7 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FBXO28Q9NVF7 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FBXO28Q9NVF7 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FBXO28Q9NVF7 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FBXO28Q9NVF7 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
FBXO28Q9NVF7 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FBXO28Q9NVF7 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FBXO28Q9NVF7 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
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