Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUW8

TDP1, Tyrosyl-DNA phosphodiesterase 1, humanhuman

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Length 608 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDP1Q9NUW8 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TDP1Q9NUW8 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TDP1Q9NUW8 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TDP1Q9NUW8 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TDP1Q9NUW8 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
TDP1Q9NUW8 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TDP1Q9NUW8 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
TDP1Q9NUW8 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TDP1Q9NUW8 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TDP1Q9NUW8 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TDP1Q9NUW8 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TDP1Q9NUW8 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TDP1Q9NUW8 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TDP1Q9NUW8 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
TDP1Q9NUW8 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TDP1Q9NUW8 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TDP1Q9NUW8 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
TDP1Q9NUW8 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC19.14■□□□□ 0.66
TDP1Q9NUW8 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TDP1Q9NUW8 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TDP1Q9NUW8 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TDP1Q9NUW8 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TDP1Q9NUW8 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TDP1Q9NUW8 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TDP1Q9NUW8 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TDP1Q9NUW8 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TDP1Q9NUW8 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
TDP1Q9NUW8 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TDP1Q9NUW8 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TDP1Q9NUW8 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TDP1Q9NUW8 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TDP1Q9NUW8 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TDP1Q9NUW8 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TDP1Q9NUW8 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
TDP1Q9NUW8 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TDP1Q9NUW8 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TDP1Q9NUW8 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TDP1Q9NUW8 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TDP1Q9NUW8 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TDP1Q9NUW8 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TDP1Q9NUW8 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TDP1Q9NUW8 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TDP1Q9NUW8 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TDP1Q9NUW8 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TDP1Q9NUW8 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TDP1Q9NUW8 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TDP1Q9NUW8 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TDP1Q9NUW8 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TDP1Q9NUW8 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TDP1Q9NUW8 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
TDP1Q9NUW8 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TDP1Q9NUW8 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TDP1Q9NUW8 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TDP1Q9NUW8 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TDP1Q9NUW8 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TDP1Q9NUW8 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TDP1Q9NUW8 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
TDP1Q9NUW8 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TDP1Q9NUW8 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TDP1Q9NUW8 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TDP1Q9NUW8 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TDP1Q9NUW8 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TDP1Q9NUW8 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TDP1Q9NUW8 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TDP1Q9NUW8 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TDP1Q9NUW8 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TDP1Q9NUW8 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TDP1Q9NUW8 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TDP1Q9NUW8 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TDP1Q9NUW8 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TDP1Q9NUW8 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TDP1Q9NUW8 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TDP1Q9NUW8 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TDP1Q9NUW8 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TDP1Q9NUW8 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TDP1Q9NUW8 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TDP1Q9NUW8 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TDP1Q9NUW8 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TDP1Q9NUW8 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TDP1Q9NUW8 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TDP1Q9NUW8 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TDP1Q9NUW8 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TDP1Q9NUW8 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TDP1Q9NUW8 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TDP1Q9NUW8 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TDP1Q9NUW8 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TDP1Q9NUW8 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TDP1Q9NUW8 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TDP1Q9NUW8 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TDP1Q9NUW8 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TDP1Q9NUW8 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TDP1Q9NUW8 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TDP1Q9NUW8 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TDP1Q9NUW8 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TDP1Q9NUW8 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
TDP1Q9NUW8 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TDP1Q9NUW8 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TDP1Q9NUW8 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TDP1Q9NUW8 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TDP1Q9NUW8 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
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