Protein–RNA interactions for Protein: Q9NU53

GINM1, Glycoprotein integral membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GINM1Q9NU53 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GINM1Q9NU53 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GINM1Q9NU53 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GINM1Q9NU53 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GINM1Q9NU53 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GINM1Q9NU53 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GINM1Q9NU53 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GINM1Q9NU53 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
GINM1Q9NU53 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GINM1Q9NU53 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GINM1Q9NU53 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GINM1Q9NU53 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
GINM1Q9NU53 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GINM1Q9NU53 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GINM1Q9NU53 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GINM1Q9NU53 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GINM1Q9NU53 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GINM1Q9NU53 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GINM1Q9NU53 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
GINM1Q9NU53 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GINM1Q9NU53 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GINM1Q9NU53 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GINM1Q9NU53 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GINM1Q9NU53 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GINM1Q9NU53 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GINM1Q9NU53 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GINM1Q9NU53 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GINM1Q9NU53 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GINM1Q9NU53 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GINM1Q9NU53 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GINM1Q9NU53 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GINM1Q9NU53 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GINM1Q9NU53 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GINM1Q9NU53 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GINM1Q9NU53 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GINM1Q9NU53 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
GINM1Q9NU53 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GINM1Q9NU53 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GINM1Q9NU53 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GINM1Q9NU53 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
GINM1Q9NU53 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
GINM1Q9NU53 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
GINM1Q9NU53 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GINM1Q9NU53 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
GINM1Q9NU53 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
GINM1Q9NU53 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
GINM1Q9NU53 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
GINM1Q9NU53 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GINM1Q9NU53 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GINM1Q9NU53 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GINM1Q9NU53 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
GINM1Q9NU53 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GINM1Q9NU53 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GINM1Q9NU53 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GINM1Q9NU53 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GINM1Q9NU53 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
GINM1Q9NU53 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GINM1Q9NU53 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GINM1Q9NU53 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GINM1Q9NU53 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GINM1Q9NU53 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GINM1Q9NU53 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
GINM1Q9NU53 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GINM1Q9NU53 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GINM1Q9NU53 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GINM1Q9NU53 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GINM1Q9NU53 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GINM1Q9NU53 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GINM1Q9NU53 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GINM1Q9NU53 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GINM1Q9NU53 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GINM1Q9NU53 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GINM1Q9NU53 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GINM1Q9NU53 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GINM1Q9NU53 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GINM1Q9NU53 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
GINM1Q9NU53 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GINM1Q9NU53 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GINM1Q9NU53 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GINM1Q9NU53 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
GINM1Q9NU53 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
GINM1Q9NU53 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GINM1Q9NU53 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GINM1Q9NU53 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GINM1Q9NU53 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GINM1Q9NU53 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GINM1Q9NU53 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GINM1Q9NU53 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GINM1Q9NU53 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GINM1Q9NU53 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GINM1Q9NU53 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GINM1Q9NU53 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GINM1Q9NU53 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GINM1Q9NU53 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GINM1Q9NU53 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GINM1Q9NU53 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GINM1Q9NU53 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GINM1Q9NU53 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GINM1Q9NU53 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GINM1Q9NU53 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms