Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP90

RAB9B, Ras-related protein Rab-9B, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB9BQ9NP90 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB9BQ9NP90 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB9BQ9NP90 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB9BQ9NP90 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB9BQ9NP90 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB9BQ9NP90 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB9BQ9NP90 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB9BQ9NP90 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB9BQ9NP90 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB9BQ9NP90 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB9BQ9NP90 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
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RAB9BQ9NP90 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB9BQ9NP90 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB9BQ9NP90 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB9BQ9NP90 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB9BQ9NP90 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB9BQ9NP90 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
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RAB9BQ9NP90 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB9BQ9NP90 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB9BQ9NP90 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB9BQ9NP90 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB9BQ9NP90 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB9BQ9NP90 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB9BQ9NP90 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB9BQ9NP90 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB9BQ9NP90 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB9BQ9NP90 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB9BQ9NP90 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB9BQ9NP90 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB9BQ9NP90 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB9BQ9NP90 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB9BQ9NP90 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB9BQ9NP90 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB9BQ9NP90 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB9BQ9NP90 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB9BQ9NP90 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB9BQ9NP90 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB9BQ9NP90 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
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RAB9BQ9NP90 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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RAB9BQ9NP90 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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RAB9BQ9NP90 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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RAB9BQ9NP90 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB9BQ9NP90 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
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RAB9BQ9NP90 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB9BQ9NP90 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB9BQ9NP90 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB9BQ9NP90 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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RAB9BQ9NP90 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB9BQ9NP90 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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RAB9BQ9NP90 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB9BQ9NP90 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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RAB9BQ9NP90 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB9BQ9NP90 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB9BQ9NP90 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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RAB9BQ9NP90 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB9BQ9NP90 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB9BQ9NP90 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB9BQ9NP90 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB9BQ9NP90 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB9BQ9NP90 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
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RAB9BQ9NP90 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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RAB9BQ9NP90 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB9BQ9NP90 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB9BQ9NP90 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB9BQ9NP90 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB9BQ9NP90 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB9BQ9NP90 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB9BQ9NP90 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
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