Protein–RNA interactions for Protein: Q9HC97

GPR35, G-protein coupled receptor 35, humanhuman

Predictions only

Length 309 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPR35Q9HC97 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GPR35Q9HC97 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GPR35Q9HC97 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GPR35Q9HC97 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GPR35Q9HC97 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
GPR35Q9HC97 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GPR35Q9HC97 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GPR35Q9HC97 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GPR35Q9HC97 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GPR35Q9HC97 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GPR35Q9HC97 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GPR35Q9HC97 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GPR35Q9HC97 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GPR35Q9HC97 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GPR35Q9HC97 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GPR35Q9HC97 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GPR35Q9HC97 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GPR35Q9HC97 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
GPR35Q9HC97 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
GPR35Q9HC97 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GPR35Q9HC97 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GPR35Q9HC97 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GPR35Q9HC97 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GPR35Q9HC97 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GPR35Q9HC97 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GPR35Q9HC97 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GPR35Q9HC97 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GPR35Q9HC97 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GPR35Q9HC97 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GPR35Q9HC97 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GPR35Q9HC97 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GPR35Q9HC97 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GPR35Q9HC97 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GPR35Q9HC97 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GPR35Q9HC97 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GPR35Q9HC97 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GPR35Q9HC97 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GPR35Q9HC97 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GPR35Q9HC97 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GPR35Q9HC97 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GPR35Q9HC97 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GPR35Q9HC97 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GPR35Q9HC97 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GPR35Q9HC97 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GPR35Q9HC97 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GPR35Q9HC97 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GPR35Q9HC97 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GPR35Q9HC97 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GPR35Q9HC97 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GPR35Q9HC97 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GPR35Q9HC97 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GPR35Q9HC97 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GPR35Q9HC97 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GPR35Q9HC97 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
GPR35Q9HC97 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
GPR35Q9HC97 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GPR35Q9HC97 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
GPR35Q9HC97 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
GPR35Q9HC97 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GPR35Q9HC97 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GPR35Q9HC97 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GPR35Q9HC97 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GPR35Q9HC97 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GPR35Q9HC97 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GPR35Q9HC97 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GPR35Q9HC97 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GPR35Q9HC97 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GPR35Q9HC97 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GPR35Q9HC97 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GPR35Q9HC97 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GPR35Q9HC97 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GPR35Q9HC97 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GPR35Q9HC97 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GPR35Q9HC97 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GPR35Q9HC97 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GPR35Q9HC97 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GPR35Q9HC97 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GPR35Q9HC97 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GPR35Q9HC97 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GPR35Q9HC97 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GPR35Q9HC97 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GPR35Q9HC97 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
GPR35Q9HC97 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GPR35Q9HC97 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GPR35Q9HC97 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GPR35Q9HC97 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GPR35Q9HC97 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GPR35Q9HC97 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GPR35Q9HC97 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GPR35Q9HC97 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GPR35Q9HC97 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GPR35Q9HC97 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GPR35Q9HC97 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GPR35Q9HC97 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GPR35Q9HC97 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GPR35Q9HC97 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GPR35Q9HC97 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GPR35Q9HC97 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GPR35Q9HC97 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GPR35Q9HC97 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.1 ms