Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZT3

SLIRP, SRA stem-loop-interacting RNA-binding protein, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLIRPQ9GZT3 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLIRPQ9GZT3 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLIRPQ9GZT3 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLIRPQ9GZT3 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLIRPQ9GZT3 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLIRPQ9GZT3 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLIRPQ9GZT3 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLIRPQ9GZT3 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLIRPQ9GZT3 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLIRPQ9GZT3 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLIRPQ9GZT3 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLIRPQ9GZT3 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLIRPQ9GZT3 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLIRPQ9GZT3 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLIRPQ9GZT3 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLIRPQ9GZT3 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLIRPQ9GZT3 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLIRPQ9GZT3 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLIRPQ9GZT3 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLIRPQ9GZT3 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLIRPQ9GZT3 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLIRPQ9GZT3 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLIRPQ9GZT3 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLIRPQ9GZT3 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SLIRPQ9GZT3 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLIRPQ9GZT3 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SLIRPQ9GZT3 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLIRPQ9GZT3 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLIRPQ9GZT3 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLIRPQ9GZT3 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLIRPQ9GZT3 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SLIRPQ9GZT3 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLIRPQ9GZT3 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLIRPQ9GZT3 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLIRPQ9GZT3 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLIRPQ9GZT3 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLIRPQ9GZT3 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLIRPQ9GZT3 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLIRPQ9GZT3 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLIRPQ9GZT3 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLIRPQ9GZT3 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLIRPQ9GZT3 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLIRPQ9GZT3 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLIRPQ9GZT3 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLIRPQ9GZT3 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLIRPQ9GZT3 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLIRPQ9GZT3 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLIRPQ9GZT3 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLIRPQ9GZT3 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLIRPQ9GZT3 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLIRPQ9GZT3 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLIRPQ9GZT3 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLIRPQ9GZT3 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLIRPQ9GZT3 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLIRPQ9GZT3 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLIRPQ9GZT3 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLIRPQ9GZT3 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLIRPQ9GZT3 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLIRPQ9GZT3 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SLIRPQ9GZT3 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLIRPQ9GZT3 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLIRPQ9GZT3 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLIRPQ9GZT3 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLIRPQ9GZT3 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLIRPQ9GZT3 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLIRPQ9GZT3 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLIRPQ9GZT3 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLIRPQ9GZT3 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLIRPQ9GZT3 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SLIRPQ9GZT3 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLIRPQ9GZT3 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLIRPQ9GZT3 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLIRPQ9GZT3 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SLIRPQ9GZT3 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLIRPQ9GZT3 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLIRPQ9GZT3 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLIRPQ9GZT3 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLIRPQ9GZT3 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLIRPQ9GZT3 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLIRPQ9GZT3 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SLIRPQ9GZT3 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLIRPQ9GZT3 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLIRPQ9GZT3 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLIRPQ9GZT3 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLIRPQ9GZT3 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLIRPQ9GZT3 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLIRPQ9GZT3 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLIRPQ9GZT3 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLIRPQ9GZT3 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLIRPQ9GZT3 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLIRPQ9GZT3 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLIRPQ9GZT3 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SLIRPQ9GZT3 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLIRPQ9GZT3 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLIRPQ9GZT3 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLIRPQ9GZT3 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLIRPQ9GZT3 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLIRPQ9GZT3 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLIRPQ9GZT3 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLIRPQ9GZT3 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms