Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZM3

POLR2J2, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB11-b1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2J2Q9GZM3 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
POLR2J2Q9GZM3 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
POLR2J2Q9GZM3 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
POLR2J2Q9GZM3 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
POLR2J2Q9GZM3 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
POLR2J2Q9GZM3 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
POLR2J2Q9GZM3 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
POLR2J2Q9GZM3 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
POLR2J2Q9GZM3 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
POLR2J2Q9GZM3 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
POLR2J2Q9GZM3 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
POLR2J2Q9GZM3 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
POLR2J2Q9GZM3 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
POLR2J2Q9GZM3 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
POLR2J2Q9GZM3 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
POLR2J2Q9GZM3 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
POLR2J2Q9GZM3 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
POLR2J2Q9GZM3 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
POLR2J2Q9GZM3 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
POLR2J2Q9GZM3 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
POLR2J2Q9GZM3 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
POLR2J2Q9GZM3 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
POLR2J2Q9GZM3 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
POLR2J2Q9GZM3 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
POLR2J2Q9GZM3 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
POLR2J2Q9GZM3 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
POLR2J2Q9GZM3 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
POLR2J2Q9GZM3 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
POLR2J2Q9GZM3 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
POLR2J2Q9GZM3 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
POLR2J2Q9GZM3 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
POLR2J2Q9GZM3 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
POLR2J2Q9GZM3 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
POLR2J2Q9GZM3 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
POLR2J2Q9GZM3 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
POLR2J2Q9GZM3 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
POLR2J2Q9GZM3 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
POLR2J2Q9GZM3 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
POLR2J2Q9GZM3 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
POLR2J2Q9GZM3 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
POLR2J2Q9GZM3 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
POLR2J2Q9GZM3 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
POLR2J2Q9GZM3 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
POLR2J2Q9GZM3 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
POLR2J2Q9GZM3 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
POLR2J2Q9GZM3 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
POLR2J2Q9GZM3 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
POLR2J2Q9GZM3 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
POLR2J2Q9GZM3 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
POLR2J2Q9GZM3 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
POLR2J2Q9GZM3 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
POLR2J2Q9GZM3 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
POLR2J2Q9GZM3 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
POLR2J2Q9GZM3 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
POLR2J2Q9GZM3 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
POLR2J2Q9GZM3 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
POLR2J2Q9GZM3 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
POLR2J2Q9GZM3 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
POLR2J2Q9GZM3 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
POLR2J2Q9GZM3 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
POLR2J2Q9GZM3 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
POLR2J2Q9GZM3 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
POLR2J2Q9GZM3 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
POLR2J2Q9GZM3 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
POLR2J2Q9GZM3 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
POLR2J2Q9GZM3 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
POLR2J2Q9GZM3 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
POLR2J2Q9GZM3 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
POLR2J2Q9GZM3 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
POLR2J2Q9GZM3 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
POLR2J2Q9GZM3 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
POLR2J2Q9GZM3 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
POLR2J2Q9GZM3 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
POLR2J2Q9GZM3 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
POLR2J2Q9GZM3 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
POLR2J2Q9GZM3 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
POLR2J2Q9GZM3 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
POLR2J2Q9GZM3 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
POLR2J2Q9GZM3 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
POLR2J2Q9GZM3 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
POLR2J2Q9GZM3 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
POLR2J2Q9GZM3 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
POLR2J2Q9GZM3 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
POLR2J2Q9GZM3 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
POLR2J2Q9GZM3 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
POLR2J2Q9GZM3 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
POLR2J2Q9GZM3 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
POLR2J2Q9GZM3 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
POLR2J2Q9GZM3 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
POLR2J2Q9GZM3 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
POLR2J2Q9GZM3 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
POLR2J2Q9GZM3 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
POLR2J2Q9GZM3 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
POLR2J2Q9GZM3 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
POLR2J2Q9GZM3 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
POLR2J2Q9GZM3 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
POLR2J2Q9GZM3 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.34
POLR2J2Q9GZM3 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC17.21■□□□□ 0.34
POLR2J2Q9GZM3 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
POLR2J2Q9GZM3 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms