Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY60

GABARAPL3, Gamma-aminobutyric acid receptor-associated protein-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABARAPL3Q9BY60 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
GABARAPL3Q9BY60 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GABARAPL3Q9BY60 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
GABARAPL3Q9BY60 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GABARAPL3Q9BY60 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GABARAPL3Q9BY60 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
GABARAPL3Q9BY60 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
GABARAPL3Q9BY60 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GABARAPL3Q9BY60 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
GABARAPL3Q9BY60 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
GABARAPL3Q9BY60 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GABARAPL3Q9BY60 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GABARAPL3Q9BY60 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
GABARAPL3Q9BY60 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
GABARAPL3Q9BY60 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
GABARAPL3Q9BY60 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GABARAPL3Q9BY60 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GABARAPL3Q9BY60 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GABARAPL3Q9BY60 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GABARAPL3Q9BY60 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GABARAPL3Q9BY60 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
GABARAPL3Q9BY60 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GABARAPL3Q9BY60 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
GABARAPL3Q9BY60 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GABARAPL3Q9BY60 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GABARAPL3Q9BY60 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
GABARAPL3Q9BY60 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
GABARAPL3Q9BY60 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
GABARAPL3Q9BY60 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
GABARAPL3Q9BY60 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
GABARAPL3Q9BY60 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GABARAPL3Q9BY60 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GABARAPL3Q9BY60 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GABARAPL3Q9BY60 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GABARAPL3Q9BY60 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
GABARAPL3Q9BY60 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GABARAPL3Q9BY60 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GABARAPL3Q9BY60 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GABARAPL3Q9BY60 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
GABARAPL3Q9BY60 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
GABARAPL3Q9BY60 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC16.93■□□□□ 0.3
GABARAPL3Q9BY60 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
GABARAPL3Q9BY60 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GABARAPL3Q9BY60 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
GABARAPL3Q9BY60 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
GABARAPL3Q9BY60 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
GABARAPL3Q9BY60 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
GABARAPL3Q9BY60 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
GABARAPL3Q9BY60 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
GABARAPL3Q9BY60 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
GABARAPL3Q9BY60 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
GABARAPL3Q9BY60 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
GABARAPL3Q9BY60 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
GABARAPL3Q9BY60 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
GABARAPL3Q9BY60 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
GABARAPL3Q9BY60 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
GABARAPL3Q9BY60 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
GABARAPL3Q9BY60 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
GABARAPL3Q9BY60 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
GABARAPL3Q9BY60 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
GABARAPL3Q9BY60 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
GABARAPL3Q9BY60 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
GABARAPL3Q9BY60 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
GABARAPL3Q9BY60 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
GABARAPL3Q9BY60 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
GABARAPL3Q9BY60 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
GABARAPL3Q9BY60 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
GABARAPL3Q9BY60 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
GABARAPL3Q9BY60 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
GABARAPL3Q9BY60 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
GABARAPL3Q9BY60 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
GABARAPL3Q9BY60 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
GABARAPL3Q9BY60 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
GABARAPL3Q9BY60 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
GABARAPL3Q9BY60 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
GABARAPL3Q9BY60 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
GABARAPL3Q9BY60 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
GABARAPL3Q9BY60 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
GABARAPL3Q9BY60 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
GABARAPL3Q9BY60 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
GABARAPL3Q9BY60 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
GABARAPL3Q9BY60 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
GABARAPL3Q9BY60 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
GABARAPL3Q9BY60 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
GABARAPL3Q9BY60 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
GABARAPL3Q9BY60 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
GABARAPL3Q9BY60 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
GABARAPL3Q9BY60 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC16.91■□□□□ 0.3
GABARAPL3Q9BY60 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
GABARAPL3Q9BY60 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
GABARAPL3Q9BY60 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
GABARAPL3Q9BY60 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
GABARAPL3Q9BY60 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
GABARAPL3Q9BY60 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
GABARAPL3Q9BY60 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
GABARAPL3Q9BY60 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
GABARAPL3Q9BY60 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
GABARAPL3Q9BY60 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
GABARAPL3Q9BY60 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
GABARAPL3Q9BY60 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.3 ms