Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXT4

TDRD1, Tudor domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,180 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDRD1Q9BXT4 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TDRD1Q9BXT4 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TDRD1Q9BXT4 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TDRD1Q9BXT4 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TDRD1Q9BXT4 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TDRD1Q9BXT4 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TDRD1Q9BXT4 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TDRD1Q9BXT4 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TDRD1Q9BXT4 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
TDRD1Q9BXT4 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TDRD1Q9BXT4 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TDRD1Q9BXT4 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TDRD1Q9BXT4 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TDRD1Q9BXT4 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TDRD1Q9BXT4 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TDRD1Q9BXT4 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TDRD1Q9BXT4 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TDRD1Q9BXT4 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TDRD1Q9BXT4 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TDRD1Q9BXT4 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
TDRD1Q9BXT4 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TDRD1Q9BXT4 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TDRD1Q9BXT4 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TDRD1Q9BXT4 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
TDRD1Q9BXT4 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TDRD1Q9BXT4 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TDRD1Q9BXT4 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TDRD1Q9BXT4 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
TDRD1Q9BXT4 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TDRD1Q9BXT4 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TDRD1Q9BXT4 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TDRD1Q9BXT4 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
TDRD1Q9BXT4 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TDRD1Q9BXT4 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TDRD1Q9BXT4 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TDRD1Q9BXT4 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TDRD1Q9BXT4 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TDRD1Q9BXT4 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TDRD1Q9BXT4 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
TDRD1Q9BXT4 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TDRD1Q9BXT4 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TDRD1Q9BXT4 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TDRD1Q9BXT4 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TDRD1Q9BXT4 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TDRD1Q9BXT4 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TDRD1Q9BXT4 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TDRD1Q9BXT4 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TDRD1Q9BXT4 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TDRD1Q9BXT4 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TDRD1Q9BXT4 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TDRD1Q9BXT4 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TDRD1Q9BXT4 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TDRD1Q9BXT4 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TDRD1Q9BXT4 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
TDRD1Q9BXT4 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TDRD1Q9BXT4 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TDRD1Q9BXT4 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TDRD1Q9BXT4 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TDRD1Q9BXT4 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TDRD1Q9BXT4 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TDRD1Q9BXT4 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TDRD1Q9BXT4 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
TDRD1Q9BXT4 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TDRD1Q9BXT4 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TDRD1Q9BXT4 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TDRD1Q9BXT4 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TDRD1Q9BXT4 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TDRD1Q9BXT4 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TDRD1Q9BXT4 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TDRD1Q9BXT4 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TDRD1Q9BXT4 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
TDRD1Q9BXT4 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
TDRD1Q9BXT4 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
TDRD1Q9BXT4 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
TDRD1Q9BXT4 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
TDRD1Q9BXT4 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
TDRD1Q9BXT4 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
TDRD1Q9BXT4 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TDRD1Q9BXT4 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TDRD1Q9BXT4 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TDRD1Q9BXT4 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TDRD1Q9BXT4 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TDRD1Q9BXT4 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TDRD1Q9BXT4 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
TDRD1Q9BXT4 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TDRD1Q9BXT4 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TDRD1Q9BXT4 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TDRD1Q9BXT4 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TDRD1Q9BXT4 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TDRD1Q9BXT4 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TDRD1Q9BXT4 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TDRD1Q9BXT4 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TDRD1Q9BXT4 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TDRD1Q9BXT4 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TDRD1Q9BXT4 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TDRD1Q9BXT4 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TDRD1Q9BXT4 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
TDRD1Q9BXT4 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TDRD1Q9BXT4 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TDRD1Q9BXT4 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
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