Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXJ4

C1QTNF3, Complement C1q tumor necrosis factor-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1QTNF3Q9BXJ4 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
C1QTNF3Q9BXJ4 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
C1QTNF3Q9BXJ4 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
C1QTNF3Q9BXJ4 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
C1QTNF3Q9BXJ4 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
C1QTNF3Q9BXJ4 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
C1QTNF3Q9BXJ4 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
C1QTNF3Q9BXJ4 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
C1QTNF3Q9BXJ4 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
C1QTNF3Q9BXJ4 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
C1QTNF3Q9BXJ4 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
C1QTNF3Q9BXJ4 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
C1QTNF3Q9BXJ4 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
C1QTNF3Q9BXJ4 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
C1QTNF3Q9BXJ4 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
C1QTNF3Q9BXJ4 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
C1QTNF3Q9BXJ4 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
C1QTNF3Q9BXJ4 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
C1QTNF3Q9BXJ4 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
C1QTNF3Q9BXJ4 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
C1QTNF3Q9BXJ4 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
C1QTNF3Q9BXJ4 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
C1QTNF3Q9BXJ4 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
C1QTNF3Q9BXJ4 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
C1QTNF3Q9BXJ4 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
C1QTNF3Q9BXJ4 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
C1QTNF3Q9BXJ4 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
C1QTNF3Q9BXJ4 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
C1QTNF3Q9BXJ4 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
C1QTNF3Q9BXJ4 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
C1QTNF3Q9BXJ4 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
C1QTNF3Q9BXJ4 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
C1QTNF3Q9BXJ4 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
C1QTNF3Q9BXJ4 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
C1QTNF3Q9BXJ4 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
C1QTNF3Q9BXJ4 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
C1QTNF3Q9BXJ4 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
C1QTNF3Q9BXJ4 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
C1QTNF3Q9BXJ4 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
C1QTNF3Q9BXJ4 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
C1QTNF3Q9BXJ4 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
C1QTNF3Q9BXJ4 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
C1QTNF3Q9BXJ4 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
C1QTNF3Q9BXJ4 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
C1QTNF3Q9BXJ4 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
C1QTNF3Q9BXJ4 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
C1QTNF3Q9BXJ4 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
C1QTNF3Q9BXJ4 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
C1QTNF3Q9BXJ4 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC18■□□□□ 0.47
C1QTNF3Q9BXJ4 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
C1QTNF3Q9BXJ4 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
C1QTNF3Q9BXJ4 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC18■□□□□ 0.47
C1QTNF3Q9BXJ4 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
C1QTNF3Q9BXJ4 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
C1QTNF3Q9BXJ4 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
C1QTNF3Q9BXJ4 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
C1QTNF3Q9BXJ4 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
C1QTNF3Q9BXJ4 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
C1QTNF3Q9BXJ4 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
C1QTNF3Q9BXJ4 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
C1QTNF3Q9BXJ4 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
C1QTNF3Q9BXJ4 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
C1QTNF3Q9BXJ4 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
C1QTNF3Q9BXJ4 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
C1QTNF3Q9BXJ4 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
C1QTNF3Q9BXJ4 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
C1QTNF3Q9BXJ4 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
C1QTNF3Q9BXJ4 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
C1QTNF3Q9BXJ4 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
C1QTNF3Q9BXJ4 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
C1QTNF3Q9BXJ4 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
C1QTNF3Q9BXJ4 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
C1QTNF3Q9BXJ4 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
C1QTNF3Q9BXJ4 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
C1QTNF3Q9BXJ4 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
C1QTNF3Q9BXJ4 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
C1QTNF3Q9BXJ4 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
C1QTNF3Q9BXJ4 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
C1QTNF3Q9BXJ4 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
C1QTNF3Q9BXJ4 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
C1QTNF3Q9BXJ4 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
C1QTNF3Q9BXJ4 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
C1QTNF3Q9BXJ4 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
C1QTNF3Q9BXJ4 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
C1QTNF3Q9BXJ4 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
C1QTNF3Q9BXJ4 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
C1QTNF3Q9BXJ4 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
C1QTNF3Q9BXJ4 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
C1QTNF3Q9BXJ4 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
C1QTNF3Q9BXJ4 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
C1QTNF3Q9BXJ4 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
C1QTNF3Q9BXJ4 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
C1QTNF3Q9BXJ4 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
C1QTNF3Q9BXJ4 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
C1QTNF3Q9BXJ4 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
C1QTNF3Q9BXJ4 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
C1QTNF3Q9BXJ4 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
C1QTNF3Q9BXJ4 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
C1QTNF3Q9BXJ4 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
C1QTNF3Q9BXJ4 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms