Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXA9

SALL3, Sal-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SALL3Q9BXA9 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
SALL3Q9BXA9 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SALL3Q9BXA9 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SALL3Q9BXA9 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SALL3Q9BXA9 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SALL3Q9BXA9 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SALL3Q9BXA9 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
SALL3Q9BXA9 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SALL3Q9BXA9 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SALL3Q9BXA9 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SALL3Q9BXA9 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SALL3Q9BXA9 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SALL3Q9BXA9 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SALL3Q9BXA9 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SALL3Q9BXA9 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SALL3Q9BXA9 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SALL3Q9BXA9 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
SALL3Q9BXA9 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SALL3Q9BXA9 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SALL3Q9BXA9 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SALL3Q9BXA9 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SALL3Q9BXA9 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SALL3Q9BXA9 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SALL3Q9BXA9 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SALL3Q9BXA9 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SALL3Q9BXA9 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SALL3Q9BXA9 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SALL3Q9BXA9 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SALL3Q9BXA9 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SALL3Q9BXA9 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SALL3Q9BXA9 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SALL3Q9BXA9 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SALL3Q9BXA9 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SALL3Q9BXA9 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SALL3Q9BXA9 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SALL3Q9BXA9 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SALL3Q9BXA9 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SALL3Q9BXA9 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SALL3Q9BXA9 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SALL3Q9BXA9 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
SALL3Q9BXA9 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SALL3Q9BXA9 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SALL3Q9BXA9 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SALL3Q9BXA9 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SALL3Q9BXA9 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SALL3Q9BXA9 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SALL3Q9BXA9 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
SALL3Q9BXA9 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SALL3Q9BXA9 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SALL3Q9BXA9 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SALL3Q9BXA9 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SALL3Q9BXA9 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SALL3Q9BXA9 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SALL3Q9BXA9 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SALL3Q9BXA9 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SALL3Q9BXA9 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SALL3Q9BXA9 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SALL3Q9BXA9 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SALL3Q9BXA9 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SALL3Q9BXA9 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SALL3Q9BXA9 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SALL3Q9BXA9 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SALL3Q9BXA9 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SALL3Q9BXA9 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SALL3Q9BXA9 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SALL3Q9BXA9 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SALL3Q9BXA9 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SALL3Q9BXA9 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SALL3Q9BXA9 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SALL3Q9BXA9 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SALL3Q9BXA9 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SALL3Q9BXA9 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SALL3Q9BXA9 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SALL3Q9BXA9 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SALL3Q9BXA9 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SALL3Q9BXA9 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
SALL3Q9BXA9 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
SALL3Q9BXA9 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
SALL3Q9BXA9 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
SALL3Q9BXA9 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SALL3Q9BXA9 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SALL3Q9BXA9 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SALL3Q9BXA9 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SALL3Q9BXA9 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SALL3Q9BXA9 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SALL3Q9BXA9 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SALL3Q9BXA9 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SALL3Q9BXA9 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SALL3Q9BXA9 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SALL3Q9BXA9 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SALL3Q9BXA9 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SALL3Q9BXA9 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SALL3Q9BXA9 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SALL3Q9BXA9 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SALL3Q9BXA9 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SALL3Q9BXA9 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SALL3Q9BXA9 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SALL3Q9BXA9 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SALL3Q9BXA9 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SALL3Q9BXA9 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms