Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSW2

CRACR2A, EF-hand calcium-binding domain-containing protein 4B, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRACR2AQ9BSW2 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CRACR2AQ9BSW2 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CRACR2AQ9BSW2 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CRACR2AQ9BSW2 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CRACR2AQ9BSW2 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CRACR2AQ9BSW2 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CRACR2AQ9BSW2 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CRACR2AQ9BSW2 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CRACR2AQ9BSW2 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CRACR2AQ9BSW2 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CRACR2AQ9BSW2 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CRACR2AQ9BSW2 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CRACR2AQ9BSW2 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CRACR2AQ9BSW2 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CRACR2AQ9BSW2 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CRACR2AQ9BSW2 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CRACR2AQ9BSW2 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CRACR2AQ9BSW2 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CRACR2AQ9BSW2 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CRACR2AQ9BSW2 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CRACR2AQ9BSW2 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CRACR2AQ9BSW2 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CRACR2AQ9BSW2 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CRACR2AQ9BSW2 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CRACR2AQ9BSW2 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CRACR2AQ9BSW2 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
CRACR2AQ9BSW2 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
CRACR2AQ9BSW2 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CRACR2AQ9BSW2 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CRACR2AQ9BSW2 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CRACR2AQ9BSW2 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CRACR2AQ9BSW2 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CRACR2AQ9BSW2 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CRACR2AQ9BSW2 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CRACR2AQ9BSW2 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CRACR2AQ9BSW2 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CRACR2AQ9BSW2 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
CRACR2AQ9BSW2 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
CRACR2AQ9BSW2 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CRACR2AQ9BSW2 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
CRACR2AQ9BSW2 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
CRACR2AQ9BSW2 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CRACR2AQ9BSW2 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CRACR2AQ9BSW2 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CRACR2AQ9BSW2 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CRACR2AQ9BSW2 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CRACR2AQ9BSW2 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
CRACR2AQ9BSW2 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CRACR2AQ9BSW2 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CRACR2AQ9BSW2 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CRACR2AQ9BSW2 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CRACR2AQ9BSW2 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CRACR2AQ9BSW2 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CRACR2AQ9BSW2 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CRACR2AQ9BSW2 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
CRACR2AQ9BSW2 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CRACR2AQ9BSW2 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CRACR2AQ9BSW2 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CRACR2AQ9BSW2 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CRACR2AQ9BSW2 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CRACR2AQ9BSW2 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CRACR2AQ9BSW2 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CRACR2AQ9BSW2 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CRACR2AQ9BSW2 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CRACR2AQ9BSW2 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CRACR2AQ9BSW2 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CRACR2AQ9BSW2 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CRACR2AQ9BSW2 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CRACR2AQ9BSW2 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CRACR2AQ9BSW2 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CRACR2AQ9BSW2 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CRACR2AQ9BSW2 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CRACR2AQ9BSW2 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CRACR2AQ9BSW2 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CRACR2AQ9BSW2 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CRACR2AQ9BSW2 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CRACR2AQ9BSW2 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CRACR2AQ9BSW2 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CRACR2AQ9BSW2 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
CRACR2AQ9BSW2 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
CRACR2AQ9BSW2 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CRACR2AQ9BSW2 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CRACR2AQ9BSW2 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CRACR2AQ9BSW2 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
CRACR2AQ9BSW2 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CRACR2AQ9BSW2 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CRACR2AQ9BSW2 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CRACR2AQ9BSW2 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CRACR2AQ9BSW2 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
CRACR2AQ9BSW2 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CRACR2AQ9BSW2 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CRACR2AQ9BSW2 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CRACR2AQ9BSW2 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CRACR2AQ9BSW2 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CRACR2AQ9BSW2 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
CRACR2AQ9BSW2 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CRACR2AQ9BSW2 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CRACR2AQ9BSW2 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CRACR2AQ9BSW2 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CRACR2AQ9BSW2 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms